Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trappc13Q3TIR1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trappc13Q3TIR1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trappc13Q3TIR1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trappc13Q3TIR1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trappc13Q3TIR1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trappc13Q3TIR1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc13Q3TIR1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc13Q3TIR1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc13Q3TIR1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc13Q3TIR1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc13Q3TIR1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc13Q3TIR1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc13Q3TIR1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc13Q3TIR1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc13Q3TIR1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc13Q3TIR1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc13Q3TIR1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc13Q3TIR1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc13Q3TIR1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc13Q3TIR1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc13Q3TIR1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc13Q3TIR1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc13Q3TIR1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc13Q3TIR1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc13Q3TIR1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc13Q3TIR1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc13Q3TIR1 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc13Q3TIR1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc13Q3TIR1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc13Q3TIR1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc13Q3TIR1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc13Q3TIR1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc13Q3TIR1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc13Q3TIR1 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc13Q3TIR1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc13Q3TIR1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc13Q3TIR1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc13Q3TIR1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc13Q3TIR1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc13Q3TIR1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc13Q3TIR1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc13Q3TIR1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc13Q3TIR1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc13Q3TIR1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc13Q3TIR1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc13Q3TIR1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc13Q3TIR1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc13Q3TIR1 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc13Q3TIR1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc13Q3TIR1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc13Q3TIR1 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc13Q3TIR1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc13Q3TIR1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc13Q3TIR1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc13Q3TIR1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc13Q3TIR1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc13Q3TIR1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc13Q3TIR1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc13Q3TIR1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc13Q3TIR1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc13Q3TIR1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc13Q3TIR1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc13Q3TIR1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc13Q3TIR1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc13Q3TIR1 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc13Q3TIR1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc13Q3TIR1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc13Q3TIR1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc13Q3TIR1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc13Q3TIR1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc13Q3TIR1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc13Q3TIR1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc13Q3TIR1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc13Q3TIR1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc13Q3TIR1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc13Q3TIR1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc13Q3TIR1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc13Q3TIR1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc13Q3TIR1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms