Protein–RNA interactions for Protein: Q08729

DSE3, Protein DSE3, yeastyeast

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DSE3Q08729 MDV1YJL112W 2145 nt3.04□□□□□ -1.92
DSE3Q08729 APC5YOR249C 2058 nt3.04□□□□□ -1.92
DSE3Q08729 PPN1YDR452W 2025 nt3.04□□□□□ -1.92
DSE3Q08729 YCR045W-AYCR045W-A 351 nt3.04□□□□□ -1.92
DSE3Q08729 SWF1YDR126W 1011 nt3.04□□□□□ -1.92
DSE3Q08729 YGR121W-AYGR121W-A 216 nt3.04□□□□□ -1.92
DSE3Q08729 YIL141WYIL141W 390 nt3.04□□□□□ -1.92
DSE3Q08729 snR54snR54 86 nt3.04□□□□□ -1.92
DSE3Q08729 SLN1YIL147C 3663 nt3.04□□□□□ -1.92
DSE3Q08729 TFC4YGR047C 3078 nt3.04□□□□□ -1.92
DSE3Q08729 RCY1YJL204C 2523 nt3.03□□□□□ -1.92
DSE3Q08729 AYT1YLL063C 1425 nt3.03□□□□□ -1.92
DSE3Q08729 VBA4YDR119W 2307 nt3.03□□□□□ -1.92
DSE3Q08729 IKI3YLR384C 4050 nt3.03□□□□□ -1.92
DSE3Q08729 SLP1YOR154W 1764 nt3.03□□□□□ -1.92
DSE3Q08729 RTS3YGR161C 792 nt3.03□□□□□ -1.92
DSE3Q08729 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt3.03□□□□□ -1.92
DSE3Q08729 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt3.03□□□□□ -1.92
DSE3Q08729 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt3.03□□□□□ -1.92
DSE3Q08729 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt3.03□□□□□ -1.92
DSE3Q08729 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt3.03□□□□□ -1.92
DSE3Q08729 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt3.03□□□□□ -1.92
DSE3Q08729 YIR014WYIR014W 729 nt3.03□□□□□ -1.92
DSE3Q08729 YAL068W-AYAL068W-A 255 nt3.03□□□□□ -1.92
DSE3Q08729 YLR287CYLR287C 1068 nt3.03□□□□□ -1.92
DSE3Q08729 YLR416CYLR416C 399 nt3.03□□□□□ -1.92
DSE3Q08729 YMR304C-AYMR304C-A 351 nt3.03□□□□□ -1.92
DSE3Q08729 YPL034WYPL034W 498 nt3.03□□□□□ -1.92
DSE3Q08729 CCT7YJL111W 1653 nt3.03□□□□□ -1.92
DSE3Q08729 BUD4YJR092W 4344 nt3.03□□□□□ -1.92
DSE3Q08729 BUB1YGR188C 3066 nt3.02□□□□□ -1.93
DSE3Q08729 SHS1YDL225W 1656 nt3.02□□□□□ -1.93
DSE3Q08729 DYN2YDR424C 279 nt3.02□□□□□ -1.93
DSE3Q08729 MIC19YFR011C 513 nt3.02□□□□□ -1.93
DSE3Q08729 RPL1BYGL135W 654 nt3.02□□□□□ -1.93
DSE3Q08729 MVB12YGR206W 306 nt3.02□□□□□ -1.93
DSE3Q08729 YJL086CYJL086C 369 nt3.02□□□□□ -1.93
DSE3Q08729 PHD1YKL043W 1101 nt3.02□□□□□ -1.93
DSE3Q08729 YLR076CYLR076C 423 nt3.02□□□□□ -1.93
DSE3Q08729 RIO2YNL207W 1278 nt3.02□□□□□ -1.93
DSE3Q08729 RPL1AYPL220W 654 nt3.02□□□□□ -1.93
DSE3Q08729 YBR285WYBR285W 435 nt3.02□□□□□ -1.93
DSE3Q08729 PIN4YBL051C 2007 nt3.02□□□□□ -1.93
DSE3Q08729 YGR237CYGR237C 2358 nt3.01□□□□□ -1.93
DSE3Q08729 RIF1YBR275C 5751 nt3.01□□□□□ -1.93
DSE3Q08729 SNA4YDL123W 423 nt3.01□□□□□ -1.93
DSE3Q08729 YER006C-AYER006C-A 318 nt3.01□□□□□ -1.93
DSE3Q08729 BIG1YHR101C 1008 nt3.01□□□□□ -1.93
DSE3Q08729 YIL046W-AYIL046W-A 165 nt3.01□□□□□ -1.93
DSE3Q08729 RNP1YLL046C 750 nt3.01□□□□□ -1.93
DSE3Q08729 YMR013C-AYMR013C-A 150 nt3.01□□□□□ -1.93
DSE3Q08729 SSN8YNL025C 972 nt3.01□□□□□ -1.93
DSE3Q08729 YPL185WYPL185W 396 nt3.01□□□□□ -1.93
DSE3Q08729 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt3.01□□□□□ -1.93
DSE3Q08729 SEC15YGL233W 2733 nt3.01□□□□□ -1.93
DSE3Q08729 YGR067CYGR067C 2415 nt3.01□□□□□ -1.93
DSE3Q08729 SYO1YDL063C 1863 nt3.01□□□□□ -1.93
DSE3Q08729 STI1YOR027W 1770 nt3□□□□□ -1.93
DSE3Q08729 PEX6YNL329C 3093 nt3□□□□□ -1.93
DSE3Q08729 PUF6YDR496C 1971 nt3□□□□□ -1.93
DSE3Q08729 EMI1YDR512C 564 nt3□□□□□ -1.93
DSE3Q08729 YER068C-AYER068C-A 432 nt3□□□□□ -1.93
DSE3Q08729 RPA12YJR063W 378 nt3□□□□□ -1.93
DSE3Q08729 YOR105WYOR105W 327 nt3□□□□□ -1.93
DSE3Q08729 FAR1YJL157C 2493 nt3□□□□□ -1.93
DSE3Q08729 RRI2YOL117W 1938 nt2.99□□□□□ -1.93
DSE3Q08729 IRC2YDR112W 309 nt2.99□□□□□ -1.93
DSE3Q08729 YHR212CYHR212C 336 nt2.99□□□□□ -1.93
DSE3Q08729 SPC1YJR010C-A 285 nt2.99□□□□□ -1.93
DSE3Q08729 YAL026C-AYAL026C-A 438 nt2.99□□□□□ -1.93
DSE3Q08729 BET3YKR068C 582 nt2.99□□□□□ -1.93
DSE3Q08729 YAR060CYAR060C 336 nt2.99□□□□□ -1.93
DSE3Q08729 YML099W-AYML099W-A 330 nt2.99□□□□□ -1.93
DSE3Q08729 MIP6YHR015W 1980 nt2.99□□□□□ -1.93
DSE3Q08729 UTP15YMR093W 1542 nt2.98□□□□□ -1.93
DSE3Q08729 DAS1YJL149W 1992 nt2.98□□□□□ -1.93
DSE3Q08729 YJL132WYJL132W 2253 nt2.98□□□□□ -1.93
DSE3Q08729 CRG1YHR209W 876 nt2.98□□□□□ -1.93
DSE3Q08729 RPL23AYBL087C 414 nt2.98□□□□□ -1.93
DSE3Q08729 YOR053WYOR053W 342 nt2.98□□□□□ -1.93
DSE3Q08729 YOR392WYOR392W 444 nt2.98□□□□□ -1.93
DSE3Q08729 AXL1YPR122W 3627 nt2.98□□□□□ -1.93
DSE3Q08729 SCY1YGL083W 2415 nt2.98□□□□□ -1.93
DSE3Q08729 REG1YDR028C 3045 nt2.98□□□□□ -1.93
DSE3Q08729 ALG8YOR067C 1734 nt2.97□□□□□ -1.93
DSE3Q08729 NAB3YPL190C 2409 nt2.97□□□□□ -1.93
DSE3Q08729 YEL075CYEL075C 369 nt2.97□□□□□ -1.93
DSE3Q08729 YFR054CYFR054C 579 nt2.97□□□□□ -1.93
DSE3Q08729 YGL015CYGL015C 393 nt2.97□□□□□ -1.93
DSE3Q08729 ERV1YGR029W 570 nt2.97□□□□□ -1.93
DSE3Q08729 RTT102YGR275W 474 nt2.97□□□□□ -1.93
DSE3Q08729 RPS20YHL015W 366 nt2.97□□□□□ -1.93
DSE3Q08729 RPS22AYJL190C 393 nt2.97□□□□□ -1.93
DSE3Q08729 FRE2YKL220C 2136 nt2.97□□□□□ -1.93
DSE3Q08729 BPT1YLL015W 4680 nt2.97□□□□□ -1.93
DSE3Q08729 MPD2YOL088C 834 nt2.97□□□□□ -1.93
DSE3Q08729 YBR062CYBR062C 543 nt2.97□□□□□ -1.93
DSE3Q08729 IRC16YPR038W 360 nt2.97□□□□□ -1.93
DSE3Q08729 DUF1YOL087C 3351 nt2.97□□□□□ -1.93
DSE3Q08729 YLR278CYLR278C 4026 nt2.97□□□□□ -1.93
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