Protein–RNA interactions for Protein: Q04742

Emx1, Homeobox protein EMX1, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx1Q04742 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Emx1Q04742 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Emx1Q04742 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Emx1Q04742 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Emx1Q04742 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Emx1Q04742 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Emx1Q04742 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Emx1Q04742 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Emx1Q04742 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Emx1Q04742 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Emx1Q04742 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Emx1Q04742 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Emx1Q04742 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Emx1Q04742 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Emx1Q04742 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Emx1Q04742 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Emx1Q04742 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Emx1Q04742 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Emx1Q04742 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Emx1Q04742 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Emx1Q04742 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Emx1Q04742 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Emx1Q04742 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Emx1Q04742 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Emx1Q04742 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Emx1Q04742 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Emx1Q04742 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Emx1Q04742 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Emx1Q04742 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Emx1Q04742 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Emx1Q04742 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Emx1Q04742 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Emx1Q04742 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Emx1Q04742 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Emx1Q04742 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Emx1Q04742 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Emx1Q04742 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Emx1Q04742 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Emx1Q04742 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Emx1Q04742 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Emx1Q04742 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Emx1Q04742 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Emx1Q04742 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Emx1Q04742 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Emx1Q04742 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Emx1Q04742 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Emx1Q04742 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Emx1Q04742 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Emx1Q04742 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Emx1Q04742 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Emx1Q04742 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Emx1Q04742 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Emx1Q04742 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Emx1Q04742 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Emx1Q04742 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Emx1Q04742 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Emx1Q04742 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Emx1Q04742 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Emx1Q04742 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Emx1Q04742 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Emx1Q04742 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Emx1Q04742 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Emx1Q04742 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Emx1Q04742 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Emx1Q04742 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Emx1Q04742 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Emx1Q04742 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Emx1Q04742 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Emx1Q04742 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Emx1Q04742 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Emx1Q04742 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Emx1Q04742 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Emx1Q04742 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Emx1Q04742 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Emx1Q04742 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Emx1Q04742 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Emx1Q04742 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Emx1Q04742 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Emx1Q04742 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Emx1Q04742 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Emx1Q04742 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Emx1Q04742 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Emx1Q04742 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Emx1Q04742 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Emx1Q04742 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Emx1Q04742 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Emx1Q04742 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Emx1Q04742 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Emx1Q04742 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Emx1Q04742 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Emx1Q04742 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Emx1Q04742 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Emx1Q04742 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Emx1Q04742 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Emx1Q04742 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Emx1Q04742 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Emx1Q04742 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Emx1Q04742 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Emx1Q04742 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Emx1Q04742 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms