Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbp1Q00915 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbp1Q00915 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbp1Q00915 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbp1Q00915 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbp1Q00915 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbp1Q00915 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbp1Q00915 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbp1Q00915 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbp1Q00915 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbp1Q00915 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rbp1Q00915 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rbp1Q00915 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rbp1Q00915 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rbp1Q00915 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rbp1Q00915 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rbp1Q00915 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rbp1Q00915 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rbp1Q00915 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rbp1Q00915 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rbp1Q00915 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rbp1Q00915 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rbp1Q00915 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rbp1Q00915 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rbp1Q00915 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rbp1Q00915 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rbp1Q00915 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbp1Q00915 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbp1Q00915 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbp1Q00915 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbp1Q00915 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbp1Q00915 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbp1Q00915 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbp1Q00915 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbp1Q00915 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbp1Q00915 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbp1Q00915 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbp1Q00915 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbp1Q00915 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rbp1Q00915 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbp1Q00915 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbp1Q00915 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbp1Q00915 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbp1Q00915 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbp1Q00915 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbp1Q00915 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbp1Q00915 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbp1Q00915 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbp1Q00915 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbp1Q00915 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbp1Q00915 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbp1Q00915 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbp1Q00915 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rbp1Q00915 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbp1Q00915 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbp1Q00915 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbp1Q00915 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbp1Q00915 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbp1Q00915 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbp1Q00915 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbp1Q00915 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbp1Q00915 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbp1Q00915 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbp1Q00915 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbp1Q00915 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbp1Q00915 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbp1Q00915 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rbp1Q00915 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbp1Q00915 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbp1Q00915 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbp1Q00915 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbp1Q00915 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbp1Q00915 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbp1Q00915 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbp1Q00915 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbp1Q00915 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbp1Q00915 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbp1Q00915 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbp1Q00915 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbp1Q00915 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbp1Q00915 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbp1Q00915 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbp1Q00915 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbp1Q00915 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbp1Q00915 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbp1Q00915 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbp1Q00915 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rbp1Q00915 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbp1Q00915 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbp1Q00915 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbp1Q00915 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbp1Q00915 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbp1Q00915 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbp1Q00915 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbp1Q00915 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbp1Q00915 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbp1Q00915 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbp1Q00915 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbp1Q00915 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rbp1Q00915 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms