Protein–RNA interactions for Protein: P70348

Gcm1, Chorion-specific transcription factor GCMa, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcm1P70348 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gcm1P70348 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gcm1P70348 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gcm1P70348 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gcm1P70348 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gcm1P70348 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gcm1P70348 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gcm1P70348 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gcm1P70348 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gcm1P70348 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gcm1P70348 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gcm1P70348 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gcm1P70348 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gcm1P70348 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gcm1P70348 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gcm1P70348 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gcm1P70348 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gcm1P70348 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gcm1P70348 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gcm1P70348 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gcm1P70348 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gcm1P70348 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gcm1P70348 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gcm1P70348 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gcm1P70348 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gcm1P70348 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gcm1P70348 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gcm1P70348 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gcm1P70348 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gcm1P70348 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gcm1P70348 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gcm1P70348 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gcm1P70348 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gcm1P70348 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gcm1P70348 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gcm1P70348 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gcm1P70348 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gcm1P70348 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gcm1P70348 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gcm1P70348 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gcm1P70348 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gcm1P70348 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gcm1P70348 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gcm1P70348 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gcm1P70348 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gcm1P70348 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gcm1P70348 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gcm1P70348 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gcm1P70348 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gcm1P70348 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gcm1P70348 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gcm1P70348 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gcm1P70348 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gcm1P70348 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gcm1P70348 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gcm1P70348 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gcm1P70348 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gcm1P70348 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gcm1P70348 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gcm1P70348 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gcm1P70348 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gcm1P70348 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gcm1P70348 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gcm1P70348 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gcm1P70348 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gcm1P70348 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gcm1P70348 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gcm1P70348 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gcm1P70348 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gcm1P70348 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gcm1P70348 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gcm1P70348 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gcm1P70348 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gcm1P70348 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gcm1P70348 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gcm1P70348 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gcm1P70348 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gcm1P70348 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gcm1P70348 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gcm1P70348 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gcm1P70348 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gcm1P70348 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gcm1P70348 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gcm1P70348 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gcm1P70348 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gcm1P70348 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gcm1P70348 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gcm1P70348 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gcm1P70348 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gcm1P70348 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gcm1P70348 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gcm1P70348 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gcm1P70348 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gcm1P70348 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gcm1P70348 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gcm1P70348 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gcm1P70348 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gcm1P70348 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gcm1P70348 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gcm1P70348 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms