Protein–RNA interactions for Protein: P70281

Sycp3, Synaptonemal complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp3P70281 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sycp3P70281 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sycp3P70281 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sycp3P70281 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Sycp3P70281 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sycp3P70281 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sycp3P70281 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sycp3P70281 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sycp3P70281 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Sycp3P70281 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sycp3P70281 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sycp3P70281 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sycp3P70281 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Sycp3P70281 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sycp3P70281 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sycp3P70281 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sycp3P70281 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sycp3P70281 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sycp3P70281 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sycp3P70281 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Sycp3P70281 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sycp3P70281 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sycp3P70281 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sycp3P70281 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sycp3P70281 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sycp3P70281 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sycp3P70281 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sycp3P70281 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sycp3P70281 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sycp3P70281 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sycp3P70281 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sycp3P70281 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sycp3P70281 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sycp3P70281 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sycp3P70281 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sycp3P70281 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sycp3P70281 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sycp3P70281 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sycp3P70281 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sycp3P70281 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sycp3P70281 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sycp3P70281 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sycp3P70281 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sycp3P70281 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Sycp3P70281 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sycp3P70281 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sycp3P70281 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sycp3P70281 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sycp3P70281 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sycp3P70281 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sycp3P70281 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sycp3P70281 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sycp3P70281 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sycp3P70281 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sycp3P70281 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sycp3P70281 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sycp3P70281 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sycp3P70281 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sycp3P70281 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sycp3P70281 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Sycp3P70281 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sycp3P70281 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Sycp3P70281 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sycp3P70281 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sycp3P70281 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sycp3P70281 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sycp3P70281 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sycp3P70281 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sycp3P70281 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sycp3P70281 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sycp3P70281 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sycp3P70281 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sycp3P70281 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sycp3P70281 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sycp3P70281 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Sycp3P70281 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sycp3P70281 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sycp3P70281 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sycp3P70281 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sycp3P70281 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sycp3P70281 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sycp3P70281 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sycp3P70281 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sycp3P70281 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sycp3P70281 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sycp3P70281 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sycp3P70281 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Sycp3P70281 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sycp3P70281 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sycp3P70281 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sycp3P70281 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sycp3P70281 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sycp3P70281 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sycp3P70281 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sycp3P70281 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sycp3P70281 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sycp3P70281 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Sycp3P70281 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sycp3P70281 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Sycp3P70281 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms