Protein–RNA interactions for Protein: P70271

Pdlim4, PDZ and LIM domain protein 4, mousemouse

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Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdlim4P70271 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pdlim4P70271 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pdlim4P70271 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Pdlim4P70271 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pdlim4P70271 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pdlim4P70271 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pdlim4P70271 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pdlim4P70271 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pdlim4P70271 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pdlim4P70271 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Pdlim4P70271 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pdlim4P70271 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pdlim4P70271 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pdlim4P70271 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pdlim4P70271 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pdlim4P70271 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pdlim4P70271 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pdlim4P70271 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pdlim4P70271 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdlim4P70271 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdlim4P70271 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdlim4P70271 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdlim4P70271 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdlim4P70271 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdlim4P70271 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdlim4P70271 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdlim4P70271 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdlim4P70271 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdlim4P70271 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdlim4P70271 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdlim4P70271 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdlim4P70271 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdlim4P70271 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdlim4P70271 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdlim4P70271 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdlim4P70271 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdlim4P70271 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdlim4P70271 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdlim4P70271 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdlim4P70271 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdlim4P70271 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdlim4P70271 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdlim4P70271 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdlim4P70271 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdlim4P70271 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdlim4P70271 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdlim4P70271 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdlim4P70271 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdlim4P70271 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdlim4P70271 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdlim4P70271 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdlim4P70271 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdlim4P70271 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdlim4P70271 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdlim4P70271 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdlim4P70271 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdlim4P70271 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdlim4P70271 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdlim4P70271 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdlim4P70271 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdlim4P70271 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdlim4P70271 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdlim4P70271 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdlim4P70271 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdlim4P70271 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdlim4P70271 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdlim4P70271 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdlim4P70271 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdlim4P70271 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdlim4P70271 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdlim4P70271 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdlim4P70271 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdlim4P70271 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdlim4P70271 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdlim4P70271 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdlim4P70271 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdlim4P70271 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdlim4P70271 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdlim4P70271 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdlim4P70271 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdlim4P70271 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdlim4P70271 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdlim4P70271 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdlim4P70271 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdlim4P70271 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdlim4P70271 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdlim4P70271 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdlim4P70271 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdlim4P70271 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdlim4P70271 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdlim4P70271 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdlim4P70271 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdlim4P70271 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdlim4P70271 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdlim4P70271 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdlim4P70271 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdlim4P70271 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdlim4P70271 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdlim4P70271 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdlim4P70271 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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