Protein–RNA interactions for Protein: P62311

Lsm3, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm3P62311 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lsm3P62311 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lsm3P62311 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lsm3P62311 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lsm3P62311 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lsm3P62311 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lsm3P62311 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lsm3P62311 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lsm3P62311 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lsm3P62311 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lsm3P62311 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lsm3P62311 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lsm3P62311 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lsm3P62311 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lsm3P62311 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lsm3P62311 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lsm3P62311 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lsm3P62311 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lsm3P62311 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lsm3P62311 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lsm3P62311 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lsm3P62311 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lsm3P62311 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lsm3P62311 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lsm3P62311 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lsm3P62311 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lsm3P62311 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lsm3P62311 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lsm3P62311 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lsm3P62311 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lsm3P62311 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lsm3P62311 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lsm3P62311 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lsm3P62311 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lsm3P62311 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lsm3P62311 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lsm3P62311 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lsm3P62311 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lsm3P62311 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lsm3P62311 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lsm3P62311 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lsm3P62311 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lsm3P62311 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lsm3P62311 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lsm3P62311 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lsm3P62311 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lsm3P62311 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lsm3P62311 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lsm3P62311 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Lsm3P62311 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lsm3P62311 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lsm3P62311 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lsm3P62311 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lsm3P62311 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lsm3P62311 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lsm3P62311 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lsm3P62311 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lsm3P62311 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lsm3P62311 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lsm3P62311 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lsm3P62311 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lsm3P62311 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lsm3P62311 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lsm3P62311 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lsm3P62311 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lsm3P62311 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lsm3P62311 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lsm3P62311 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lsm3P62311 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lsm3P62311 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lsm3P62311 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lsm3P62311 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lsm3P62311 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lsm3P62311 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lsm3P62311 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lsm3P62311 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lsm3P62311 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lsm3P62311 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lsm3P62311 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lsm3P62311 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lsm3P62311 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lsm3P62311 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lsm3P62311 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lsm3P62311 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lsm3P62311 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lsm3P62311 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lsm3P62311 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lsm3P62311 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lsm3P62311 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lsm3P62311 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lsm3P62311 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lsm3P62311 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lsm3P62311 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lsm3P62311 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lsm3P62311 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lsm3P62311 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lsm3P62311 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lsm3P62311 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lsm3P62311 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lsm3P62311 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms