Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gsc2P56916 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gsc2P56916 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms