Protein–RNA interactions for Protein: P56528

Cd38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd38P56528 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd38P56528 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd38P56528 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd38P56528 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd38P56528 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd38P56528 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd38P56528 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd38P56528 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd38P56528 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd38P56528 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd38P56528 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd38P56528 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd38P56528 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd38P56528 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd38P56528 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd38P56528 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd38P56528 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd38P56528 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd38P56528 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd38P56528 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd38P56528 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd38P56528 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd38P56528 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd38P56528 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd38P56528 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cd38P56528 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cd38P56528 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd38P56528 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd38P56528 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd38P56528 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd38P56528 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd38P56528 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd38P56528 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd38P56528 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd38P56528 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cd38P56528 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd38P56528 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd38P56528 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd38P56528 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd38P56528 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd38P56528 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd38P56528 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd38P56528 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd38P56528 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd38P56528 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd38P56528 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd38P56528 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd38P56528 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd38P56528 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd38P56528 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd38P56528 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd38P56528 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd38P56528 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd38P56528 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd38P56528 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd38P56528 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd38P56528 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd38P56528 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cd38P56528 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd38P56528 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd38P56528 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd38P56528 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd38P56528 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd38P56528 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd38P56528 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd38P56528 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd38P56528 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd38P56528 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd38P56528 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd38P56528 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd38P56528 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd38P56528 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd38P56528 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cd38P56528 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd38P56528 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd38P56528 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd38P56528 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd38P56528 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd38P56528 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd38P56528 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd38P56528 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd38P56528 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd38P56528 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd38P56528 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd38P56528 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd38P56528 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd38P56528 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd38P56528 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd38P56528 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd38P56528 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cd38P56528 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd38P56528 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd38P56528 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd38P56528 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd38P56528 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd38P56528 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd38P56528 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd38P56528 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd38P56528 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd38P56528 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms