Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Aqp4P55088 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Aqp4P55088 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Aqp4P55088 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Aqp4P55088 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Aqp4P55088 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Aqp4P55088 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Aqp4P55088 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Aqp4P55088 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Aqp4P55088 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Aqp4P55088 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Aqp4P55088 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Aqp4P55088 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Aqp4P55088 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Aqp4P55088 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Aqp4P55088 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Aqp4P55088 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Aqp4P55088 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Aqp4P55088 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Aqp4P55088 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Aqp4P55088 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Aqp4P55088 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Aqp4P55088 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Aqp4P55088 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Aqp4P55088 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Aqp4P55088 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Aqp4P55088 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Aqp4P55088 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Aqp4P55088 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Aqp4P55088 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Aqp4P55088 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Aqp4P55088 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Aqp4P55088 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Aqp4P55088 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Aqp4P55088 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Aqp4P55088 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Aqp4P55088 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Aqp4P55088 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Aqp4P55088 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Aqp4P55088 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Aqp4P55088 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Aqp4P55088 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Aqp4P55088 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Aqp4P55088 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Aqp4P55088 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Aqp4P55088 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Aqp4P55088 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Aqp4P55088 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Aqp4P55088 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Aqp4P55088 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Aqp4P55088 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Aqp4P55088 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Aqp4P55088 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Aqp4P55088 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Aqp4P55088 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Aqp4P55088 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Aqp4P55088 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Aqp4P55088 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Aqp4P55088 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Aqp4P55088 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Aqp4P55088 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Aqp4P55088 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Aqp4P55088 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Aqp4P55088 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Aqp4P55088 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Aqp4P55088 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Aqp4P55088 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Aqp4P55088 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Aqp4P55088 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms