Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EPHB4P54760 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EPHB4P54760 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EPHB4P54760 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
EPHB4P54760 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EPHB4P54760 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EPHB4P54760 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EPHB4P54760 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EPHB4P54760 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EPHB4P54760 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EPHB4P54760 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EPHB4P54760 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EPHB4P54760 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EPHB4P54760 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EPHB4P54760 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EPHB4P54760 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPHB4P54760 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPHB4P54760 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
EPHB4P54760 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPHB4P54760 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPHB4P54760 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPHB4P54760 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPHB4P54760 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
EPHB4P54760 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EPHB4P54760 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EPHB4P54760 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EPHB4P54760 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EPHB4P54760 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EPHB4P54760 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EPHB4P54760 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
EPHB4P54760 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EPHB4P54760 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EPHB4P54760 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
EPHB4P54760 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
EPHB4P54760 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EPHB4P54760 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EPHB4P54760 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EPHB4P54760 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EPHB4P54760 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EPHB4P54760 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EPHB4P54760 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EPHB4P54760 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EPHB4P54760 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
EPHB4P54760 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EPHB4P54760 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EPHB4P54760 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EPHB4P54760 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EPHB4P54760 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
EPHB4P54760 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EPHB4P54760 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EPHB4P54760 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EPHB4P54760 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EPHB4P54760 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EPHB4P54760 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EPHB4P54760 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EPHB4P54760 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EPHB4P54760 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EPHB4P54760 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EPHB4P54760 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EPHB4P54760 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EPHB4P54760 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EPHB4P54760 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EPHB4P54760 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EPHB4P54760 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EPHB4P54760 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
EPHB4P54760 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
EPHB4P54760 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
EPHB4P54760 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms