Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtgfrP43117 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtgfrP43117 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtgfrP43117 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtgfrP43117 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtgfrP43117 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtgfrP43117 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PtgfrP43117 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtgfrP43117 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtgfrP43117 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtgfrP43117 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtgfrP43117 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtgfrP43117 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtgfrP43117 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtgfrP43117 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PtgfrP43117 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PtgfrP43117 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtgfrP43117 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtgfrP43117 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtgfrP43117 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtgfrP43117 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtgfrP43117 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtgfrP43117 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtgfrP43117 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtgfrP43117 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtgfrP43117 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PtgfrP43117 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PtgfrP43117 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtgfrP43117 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtgfrP43117 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtgfrP43117 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtgfrP43117 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtgfrP43117 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PtgfrP43117 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtgfrP43117 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtgfrP43117 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtgfrP43117 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtgfrP43117 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtgfrP43117 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtgfrP43117 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtgfrP43117 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtgfrP43117 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtgfrP43117 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtgfrP43117 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtgfrP43117 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtgfrP43117 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtgfrP43117 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtgfrP43117 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtgfrP43117 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtgfrP43117 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtgfrP43117 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtgfrP43117 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtgfrP43117 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PtgfrP43117 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PtgfrP43117 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtgfrP43117 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtgfrP43117 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtgfrP43117 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtgfrP43117 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PtgfrP43117 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtgfrP43117 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtgfrP43117 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtgfrP43117 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PtgfrP43117 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtgfrP43117 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtgfrP43117 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtgfrP43117 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtgfrP43117 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtgfrP43117 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtgfrP43117 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtgfrP43117 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtgfrP43117 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtgfrP43117 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtgfrP43117 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtgfrP43117 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtgfrP43117 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtgfrP43117 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtgfrP43117 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtgfrP43117 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PtgfrP43117 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtgfrP43117 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtgfrP43117 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtgfrP43117 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtgfrP43117 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtgfrP43117 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtgfrP43117 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PtgfrP43117 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PtgfrP43117 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtgfrP43117 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtgfrP43117 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtgfrP43117 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtgfrP43117 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtgfrP43117 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtgfrP43117 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtgfrP43117 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtgfrP43117 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtgfrP43117 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtgfrP43117 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtgfrP43117 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PtgfrP43117 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms