Protein–RNA interactions for Protein: P41245

Mmp9, Matrix metalloproteinase-9, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp9P41245 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp9P41245 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp9P41245 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mmp9P41245 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mmp9P41245 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp9P41245 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp9P41245 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp9P41245 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp9P41245 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp9P41245 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp9P41245 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp9P41245 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp9P41245 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp9P41245 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp9P41245 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mmp9P41245 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp9P41245 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp9P41245 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp9P41245 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp9P41245 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp9P41245 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Mmp9P41245 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp9P41245 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp9P41245 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Mmp9P41245 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp9P41245 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp9P41245 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp9P41245 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp9P41245 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp9P41245 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp9P41245 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Mmp9P41245 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp9P41245 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp9P41245 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp9P41245 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp9P41245 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
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Mmp9P41245 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Mmp9P41245 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp9P41245 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Mmp9P41245 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Mmp9P41245 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mmp9P41245 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
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Mmp9P41245 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mmp9P41245 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mmp9P41245 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
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Mmp9P41245 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Mmp9P41245 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Mmp9P41245 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp9P41245 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp9P41245 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp9P41245 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp9P41245 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp9P41245 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Mmp9P41245 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp9P41245 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp9P41245 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp9P41245 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp9P41245 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp9P41245 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp9P41245 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp9P41245 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp9P41245 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.04■□□□□ -0
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Mmp9P41245 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Mmp9P41245 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp9P41245 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp9P41245 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp9P41245 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mmp9P41245 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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