Protein–RNA interactions for Protein: P38575

Upk2, Uroplakin-2, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk2P38575 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Upk2P38575 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Upk2P38575 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Upk2P38575 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Upk2P38575 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Upk2P38575 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Upk2P38575 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Upk2P38575 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Upk2P38575 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Upk2P38575 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Upk2P38575 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Upk2P38575 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Upk2P38575 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Upk2P38575 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Upk2P38575 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Upk2P38575 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Upk2P38575 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Upk2P38575 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Upk2P38575 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Upk2P38575 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Upk2P38575 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Upk2P38575 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Upk2P38575 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Upk2P38575 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Upk2P38575 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Upk2P38575 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Upk2P38575 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Upk2P38575 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Upk2P38575 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Upk2P38575 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Upk2P38575 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upk2P38575 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upk2P38575 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upk2P38575 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upk2P38575 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upk2P38575 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upk2P38575 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upk2P38575 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upk2P38575 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upk2P38575 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upk2P38575 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upk2P38575 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upk2P38575 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upk2P38575 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upk2P38575 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upk2P38575 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upk2P38575 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upk2P38575 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upk2P38575 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Upk2P38575 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upk2P38575 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upk2P38575 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upk2P38575 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upk2P38575 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upk2P38575 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Upk2P38575 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upk2P38575 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upk2P38575 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Upk2P38575 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upk2P38575 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upk2P38575 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upk2P38575 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upk2P38575 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upk2P38575 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Upk2P38575 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Upk2P38575 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Upk2P38575 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Upk2P38575 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Upk2P38575 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Upk2P38575 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Upk2P38575 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Upk2P38575 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Upk2P38575 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Upk2P38575 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Upk2P38575 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Upk2P38575 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Upk2P38575 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Upk2P38575 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Upk2P38575 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upk2P38575 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upk2P38575 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upk2P38575 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upk2P38575 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upk2P38575 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upk2P38575 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upk2P38575 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upk2P38575 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upk2P38575 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Upk2P38575 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upk2P38575 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upk2P38575 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Upk2P38575 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upk2P38575 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upk2P38575 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upk2P38575 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upk2P38575 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upk2P38575 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upk2P38575 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upk2P38575 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Upk2P38575 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms