Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PpargP37238 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PpargP37238 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PpargP37238 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PpargP37238 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PpargP37238 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PpargP37238 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PpargP37238 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PpargP37238 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PpargP37238 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PpargP37238 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PpargP37238 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PpargP37238 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PpargP37238 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PpargP37238 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PpargP37238 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PpargP37238 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PpargP37238 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PpargP37238 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PpargP37238 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PpargP37238 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PpargP37238 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PpargP37238 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PpargP37238 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PpargP37238 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PpargP37238 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PpargP37238 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PpargP37238 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PpargP37238 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PpargP37238 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PpargP37238 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PpargP37238 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PpargP37238 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PpargP37238 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PpargP37238 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PpargP37238 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PpargP37238 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PpargP37238 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PpargP37238 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PpargP37238 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PpargP37238 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PpargP37238 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PpargP37238 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PpargP37238 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PpargP37238 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PpargP37238 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PpargP37238 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PpargP37238 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PpargP37238 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PpargP37238 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PpargP37238 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PpargP37238 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PpargP37238 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PpargP37238 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PpargP37238 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PpargP37238 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PpargP37238 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PpargP37238 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PpargP37238 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PpargP37238 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PpargP37238 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PpargP37238 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PpargP37238 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PpargP37238 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PpargP37238 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PpargP37238 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PpargP37238 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PpargP37238 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PpargP37238 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PpargP37238 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PpargP37238 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PpargP37238 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PpargP37238 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PpargP37238 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PpargP37238 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PpargP37238 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PpargP37238 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PpargP37238 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PpargP37238 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PpargP37238 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PpargP37238 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PpargP37238 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PpargP37238 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PpargP37238 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PpargP37238 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PpargP37238 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PpargP37238 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PpargP37238 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PpargP37238 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PpargP37238 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PpargP37238 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PpargP37238 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PpargP37238 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PpargP37238 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PpargP37238 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PpargP37238 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PpargP37238 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PpargP37238 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PpargP37238 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PpargP37238 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 235 ms