Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pabpc1P29341 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pabpc1P29341 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pabpc1P29341 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pabpc1P29341 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pabpc1P29341 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pabpc1P29341 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pabpc1P29341 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pabpc1P29341 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pabpc1P29341 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pabpc1P29341 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pabpc1P29341 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pabpc1P29341 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Pabpc1P29341 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pabpc1P29341 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Pabpc1P29341 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pabpc1P29341 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pabpc1P29341 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pabpc1P29341 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pabpc1P29341 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pabpc1P29341 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pabpc1P29341 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pabpc1P29341 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pabpc1P29341 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pabpc1P29341 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pabpc1P29341 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pabpc1P29341 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pabpc1P29341 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Pabpc1P29341 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pabpc1P29341 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pabpc1P29341 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pabpc1P29341 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pabpc1P29341 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pabpc1P29341 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pabpc1P29341 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Pabpc1P29341 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pabpc1P29341 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Pabpc1P29341 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pabpc1P29341 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pabpc1P29341 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pabpc1P29341 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pabpc1P29341 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pabpc1P29341 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pabpc1P29341 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pabpc1P29341 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pabpc1P29341 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pabpc1P29341 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pabpc1P29341 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pabpc1P29341 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pabpc1P29341 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pabpc1P29341 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pabpc1P29341 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Pabpc1P29341 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Pabpc1P29341 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pabpc1P29341 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Pabpc1P29341 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pabpc1P29341 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pabpc1P29341 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pabpc1P29341 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Pabpc1P29341 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Pabpc1P29341 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Pabpc1P29341 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Pabpc1P29341 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pabpc1P29341 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pabpc1P29341 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pabpc1P29341 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pabpc1P29341 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pabpc1P29341 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pabpc1P29341 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pabpc1P29341 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pabpc1P29341 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pabpc1P29341 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pabpc1P29341 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pabpc1P29341 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pabpc1P29341 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pabpc1P29341 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pabpc1P29341 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pabpc1P29341 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pabpc1P29341 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Pabpc1P29341 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pabpc1P29341 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pabpc1P29341 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pabpc1P29341 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pabpc1P29341 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pabpc1P29341 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Pabpc1P29341 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pabpc1P29341 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pabpc1P29341 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pabpc1P29341 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pabpc1P29341 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pabpc1P29341 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pabpc1P29341 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pabpc1P29341 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pabpc1P29341 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pabpc1P29341 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pabpc1P29341 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pabpc1P29341 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pabpc1P29341 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pabpc1P29341 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pabpc1P29341 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms