Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gja1P23242 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gja1P23242 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gja1P23242 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gja1P23242 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gja1P23242 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gja1P23242 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gja1P23242 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gja1P23242 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gja1P23242 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gja1P23242 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gja1P23242 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gja1P23242 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gja1P23242 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gja1P23242 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gja1P23242 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gja1P23242 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gja1P23242 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gja1P23242 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gja1P23242 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gja1P23242 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gja1P23242 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gja1P23242 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gja1P23242 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gja1P23242 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gja1P23242 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gja1P23242 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gja1P23242 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gja1P23242 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gja1P23242 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gja1P23242 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gja1P23242 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gja1P23242 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gja1P23242 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gja1P23242 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gja1P23242 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gja1P23242 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gja1P23242 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gja1P23242 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gja1P23242 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gja1P23242 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gja1P23242 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gja1P23242 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gja1P23242 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gja1P23242 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gja1P23242 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gja1P23242 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gja1P23242 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gja1P23242 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gja1P23242 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gja1P23242 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gja1P23242 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gja1P23242 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gja1P23242 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gja1P23242 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gja1P23242 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gja1P23242 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gja1P23242 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gja1P23242 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gja1P23242 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gja1P23242 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gja1P23242 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gja1P23242 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gja1P23242 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gja1P23242 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gja1P23242 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gja1P23242 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gja1P23242 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gja1P23242 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gja1P23242 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gja1P23242 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gja1P23242 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gja1P23242 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gja1P23242 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gja1P23242 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gja1P23242 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gja1P23242 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gja1P23242 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gja1P23242 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gja1P23242 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gja1P23242 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gja1P23242 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gja1P23242 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gja1P23242 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gja1P23242 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gja1P23242 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gja1P23242 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gja1P23242 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gja1P23242 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gja1P23242 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gja1P23242 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gja1P23242 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gja1P23242 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gja1P23242 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gja1P23242 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gja1P23242 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gja1P23242 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gja1P23242 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gja1P23242 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gja1P23242 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms