Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ntf3P20181 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ntf3P20181 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms