Protein–RNA interactions for Protein: P18761

Ca6, Carbonic anhydrase 6, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ca6P18761 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ca6P18761 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ca6P18761 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ca6P18761 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ca6P18761 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ca6P18761 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ca6P18761 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ca6P18761 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ca6P18761 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ca6P18761 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ca6P18761 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ca6P18761 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ca6P18761 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ca6P18761 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ca6P18761 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ca6P18761 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ca6P18761 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ca6P18761 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ca6P18761 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ca6P18761 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ca6P18761 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ca6P18761 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ca6P18761 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ca6P18761 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ca6P18761 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ca6P18761 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ca6P18761 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ca6P18761 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ca6P18761 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ca6P18761 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ca6P18761 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ca6P18761 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ca6P18761 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ca6P18761 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ca6P18761 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ca6P18761 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ca6P18761 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ca6P18761 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ca6P18761 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ca6P18761 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ca6P18761 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ca6P18761 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ca6P18761 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ca6P18761 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ca6P18761 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ca6P18761 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ca6P18761 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ca6P18761 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ca6P18761 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ca6P18761 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ca6P18761 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ca6P18761 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ca6P18761 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ca6P18761 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ca6P18761 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ca6P18761 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ca6P18761 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ca6P18761 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ca6P18761 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ca6P18761 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ca6P18761 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ca6P18761 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ca6P18761 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ca6P18761 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ca6P18761 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ca6P18761 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ca6P18761 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ca6P18761 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ca6P18761 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ca6P18761 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ca6P18761 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ca6P18761 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ca6P18761 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ca6P18761 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ca6P18761 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ca6P18761 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ca6P18761 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ca6P18761 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ca6P18761 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ca6P18761 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ca6P18761 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ca6P18761 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ca6P18761 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ca6P18761 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ca6P18761 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ca6P18761 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ca6P18761 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ca6P18761 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ca6P18761 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ca6P18761 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ca6P18761 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ca6P18761 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ca6P18761 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ca6P18761 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ca6P18761 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ca6P18761 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ca6P18761 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ca6P18761 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ca6P18761 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ca6P18761 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms