Protein–RNA interactions for Protein: P17544

ATF7, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF7P17544 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATF7P17544 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATF7P17544 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATF7P17544 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATF7P17544 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATF7P17544 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATF7P17544 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATF7P17544 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ATF7P17544 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATF7P17544 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATF7P17544 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATF7P17544 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATF7P17544 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ATF7P17544 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATF7P17544 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATF7P17544 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATF7P17544 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATF7P17544 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATF7P17544 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATF7P17544 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATF7P17544 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATF7P17544 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ATF7P17544 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATF7P17544 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATF7P17544 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATF7P17544 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATF7P17544 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATF7P17544 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATF7P17544 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ATF7P17544 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATF7P17544 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATF7P17544 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATF7P17544 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATF7P17544 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATF7P17544 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATF7P17544 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATF7P17544 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATF7P17544 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATF7P17544 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATF7P17544 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATF7P17544 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATF7P17544 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATF7P17544 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATF7P17544 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATF7P17544 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATF7P17544 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATF7P17544 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATF7P17544 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATF7P17544 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATF7P17544 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATF7P17544 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATF7P17544 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATF7P17544 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATF7P17544 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATF7P17544 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATF7P17544 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATF7P17544 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATF7P17544 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATF7P17544 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATF7P17544 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATF7P17544 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATF7P17544 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATF7P17544 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATF7P17544 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATF7P17544 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATF7P17544 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATF7P17544 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATF7P17544 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATF7P17544 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATF7P17544 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATF7P17544 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATF7P17544 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATF7P17544 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATF7P17544 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATF7P17544 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATF7P17544 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATF7P17544 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATF7P17544 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ATF7P17544 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATF7P17544 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATF7P17544 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATF7P17544 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATF7P17544 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATF7P17544 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATF7P17544 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATF7P17544 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATF7P17544 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATF7P17544 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATF7P17544 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATF7P17544 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATF7P17544 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATF7P17544 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATF7P17544 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATF7P17544 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATF7P17544 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATF7P17544 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ATF7P17544 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ATF7P17544 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATF7P17544 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATF7P17544 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms