Protein–RNA interactions for Protein: O89110

Casp8, Caspase-8, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp8O89110 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Casp8O89110 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Casp8O89110 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Casp8O89110 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Casp8O89110 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Casp8O89110 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Casp8O89110 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Casp8O89110 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Casp8O89110 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Casp8O89110 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Casp8O89110 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Casp8O89110 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Casp8O89110 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Casp8O89110 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Casp8O89110 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Casp8O89110 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Casp8O89110 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Casp8O89110 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Casp8O89110 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Casp8O89110 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Casp8O89110 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Casp8O89110 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Casp8O89110 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Casp8O89110 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Casp8O89110 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Casp8O89110 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Casp8O89110 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Casp8O89110 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Casp8O89110 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Casp8O89110 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Casp8O89110 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Casp8O89110 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Casp8O89110 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Casp8O89110 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Casp8O89110 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Casp8O89110 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Casp8O89110 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Casp8O89110 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Casp8O89110 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Casp8O89110 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Casp8O89110 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Casp8O89110 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Casp8O89110 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Casp8O89110 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Casp8O89110 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Casp8O89110 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Casp8O89110 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Casp8O89110 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Casp8O89110 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Casp8O89110 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Casp8O89110 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Casp8O89110 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Casp8O89110 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Casp8O89110 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Casp8O89110 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Casp8O89110 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Casp8O89110 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Casp8O89110 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Casp8O89110 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Casp8O89110 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Casp8O89110 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Casp8O89110 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Casp8O89110 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Casp8O89110 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Casp8O89110 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Casp8O89110 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Casp8O89110 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Casp8O89110 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Casp8O89110 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Casp8O89110 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Casp8O89110 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Casp8O89110 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Casp8O89110 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Casp8O89110 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Casp8O89110 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Casp8O89110 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Casp8O89110 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Casp8O89110 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Casp8O89110 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Casp8O89110 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Casp8O89110 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Casp8O89110 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Casp8O89110 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Casp8O89110 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Casp8O89110 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Casp8O89110 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Casp8O89110 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Casp8O89110 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Casp8O89110 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Casp8O89110 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Casp8O89110 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Casp8O89110 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Casp8O89110 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Casp8O89110 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Casp8O89110 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Casp8O89110 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Casp8O89110 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Casp8O89110 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Casp8O89110 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Casp8O89110 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms