Protein–RNA interactions for Protein: O88543

Cops3, COP9 signalosome complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops3O88543 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cops3O88543 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cops3O88543 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cops3O88543 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cops3O88543 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cops3O88543 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cops3O88543 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cops3O88543 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cops3O88543 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cops3O88543 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cops3O88543 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cops3O88543 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cops3O88543 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cops3O88543 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cops3O88543 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cops3O88543 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cops3O88543 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cops3O88543 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cops3O88543 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cops3O88543 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cops3O88543 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cops3O88543 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cops3O88543 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cops3O88543 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cops3O88543 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cops3O88543 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cops3O88543 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cops3O88543 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cops3O88543 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cops3O88543 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cops3O88543 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cops3O88543 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cops3O88543 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cops3O88543 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cops3O88543 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cops3O88543 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cops3O88543 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cops3O88543 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cops3O88543 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cops3O88543 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cops3O88543 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cops3O88543 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cops3O88543 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cops3O88543 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cops3O88543 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cops3O88543 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cops3O88543 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cops3O88543 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cops3O88543 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cops3O88543 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cops3O88543 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cops3O88543 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cops3O88543 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cops3O88543 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cops3O88543 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cops3O88543 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cops3O88543 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cops3O88543 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cops3O88543 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cops3O88543 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cops3O88543 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cops3O88543 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cops3O88543 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cops3O88543 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cops3O88543 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cops3O88543 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cops3O88543 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cops3O88543 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cops3O88543 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cops3O88543 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cops3O88543 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cops3O88543 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cops3O88543 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms