Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Opn1mwO35599 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Opn1mwO35599 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Opn1mwO35599 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Opn1mwO35599 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Opn1mwO35599 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Opn1mwO35599 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Opn1mwO35599 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Opn1mwO35599 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Opn1mwO35599 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Opn1mwO35599 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Opn1mwO35599 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Opn1mwO35599 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Opn1mwO35599 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Opn1mwO35599 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Opn1mwO35599 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Opn1mwO35599 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Opn1mwO35599 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Opn1mwO35599 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Opn1mwO35599 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Opn1mwO35599 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Opn1mwO35599 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Opn1mwO35599 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Opn1mwO35599 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Opn1mwO35599 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Opn1mwO35599 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Opn1mwO35599 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Opn1mwO35599 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Opn1mwO35599 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Opn1mwO35599 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Opn1mwO35599 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Opn1mwO35599 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Opn1mwO35599 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Opn1mwO35599 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Opn1mwO35599 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Opn1mwO35599 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Opn1mwO35599 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Opn1mwO35599 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Opn1mwO35599 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Opn1mwO35599 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Opn1mwO35599 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Opn1mwO35599 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Opn1mwO35599 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Opn1mwO35599 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Opn1mwO35599 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Opn1mwO35599 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Opn1mwO35599 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Opn1mwO35599 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Opn1mwO35599 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Opn1mwO35599 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Opn1mwO35599 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Opn1mwO35599 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Opn1mwO35599 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Opn1mwO35599 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Opn1mwO35599 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Opn1mwO35599 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Opn1mwO35599 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Opn1mwO35599 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Opn1mwO35599 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Opn1mwO35599 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Opn1mwO35599 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Opn1mwO35599 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Opn1mwO35599 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Opn1mwO35599 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Opn1mwO35599 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Opn1mwO35599 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Opn1mwO35599 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Opn1mwO35599 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Opn1mwO35599 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Opn1mwO35599 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Opn1mwO35599 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Opn1mwO35599 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Opn1mwO35599 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Opn1mwO35599 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Opn1mwO35599 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Opn1mwO35599 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Opn1mwO35599 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Opn1mwO35599 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Opn1mwO35599 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Opn1mwO35599 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Opn1mwO35599 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Opn1mwO35599 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Opn1mwO35599 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Opn1mwO35599 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Opn1mwO35599 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Opn1mwO35599 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Opn1mwO35599 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Opn1mwO35599 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Opn1mwO35599 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Opn1mwO35599 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Opn1mwO35599 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Opn1mwO35599 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Opn1mwO35599 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Opn1mwO35599 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Opn1mwO35599 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Opn1mwO35599 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Opn1mwO35599 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Opn1mwO35599 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Opn1mwO35599 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Opn1mwO35599 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms