Protein–RNA interactions for Protein: J3QNR8

Trim34b, Tripartite motif-containing 34B, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim34bJ3QNR8 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim34bJ3QNR8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim34bJ3QNR8 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim34bJ3QNR8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim34bJ3QNR8 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim34bJ3QNR8 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim34bJ3QNR8 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim34bJ3QNR8 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim34bJ3QNR8 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim34bJ3QNR8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim34bJ3QNR8 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim34bJ3QNR8 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim34bJ3QNR8 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim34bJ3QNR8 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim34bJ3QNR8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim34bJ3QNR8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim34bJ3QNR8 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim34bJ3QNR8 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim34bJ3QNR8 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim34bJ3QNR8 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim34bJ3QNR8 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim34bJ3QNR8 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim34bJ3QNR8 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim34bJ3QNR8 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim34bJ3QNR8 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim34bJ3QNR8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim34bJ3QNR8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim34bJ3QNR8 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim34bJ3QNR8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim34bJ3QNR8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim34bJ3QNR8 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim34bJ3QNR8 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim34bJ3QNR8 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim34bJ3QNR8 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim34bJ3QNR8 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim34bJ3QNR8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim34bJ3QNR8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim34bJ3QNR8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim34bJ3QNR8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim34bJ3QNR8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim34bJ3QNR8 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim34bJ3QNR8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim34bJ3QNR8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim34bJ3QNR8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim34bJ3QNR8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim34bJ3QNR8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim34bJ3QNR8 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim34bJ3QNR8 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim34bJ3QNR8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim34bJ3QNR8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim34bJ3QNR8 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim34bJ3QNR8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim34bJ3QNR8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim34bJ3QNR8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim34bJ3QNR8 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim34bJ3QNR8 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Trim34bJ3QNR8 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim34bJ3QNR8 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim34bJ3QNR8 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim34bJ3QNR8 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim34bJ3QNR8 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim34bJ3QNR8 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim34bJ3QNR8 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim34bJ3QNR8 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim34bJ3QNR8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim34bJ3QNR8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim34bJ3QNR8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim34bJ3QNR8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim34bJ3QNR8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim34bJ3QNR8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim34bJ3QNR8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim34bJ3QNR8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim34bJ3QNR8 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Trim34bJ3QNR8 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim34bJ3QNR8 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim34bJ3QNR8 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim34bJ3QNR8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim34bJ3QNR8 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim34bJ3QNR8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim34bJ3QNR8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim34bJ3QNR8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim34bJ3QNR8 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim34bJ3QNR8 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim34bJ3QNR8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim34bJ3QNR8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim34bJ3QNR8 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim34bJ3QNR8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim34bJ3QNR8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim34bJ3QNR8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim34bJ3QNR8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim34bJ3QNR8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim34bJ3QNR8 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim34bJ3QNR8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim34bJ3QNR8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim34bJ3QNR8 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim34bJ3QNR8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim34bJ3QNR8 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim34bJ3QNR8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim34bJ3QNR8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim34bJ3QNR8 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms