Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm28048F7BCN0 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm28048F7BCN0 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm28048F7BCN0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm28048F7BCN0 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm28048F7BCN0 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm28048F7BCN0 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm28048F7BCN0 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm28048F7BCN0 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm28048F7BCN0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm28048F7BCN0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm28048F7BCN0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm28048F7BCN0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm28048F7BCN0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm28048F7BCN0 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm28048F7BCN0 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm28048F7BCN0 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm28048F7BCN0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm28048F7BCN0 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm28048F7BCN0 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm28048F7BCN0 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm28048F7BCN0 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm28048F7BCN0 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm28048F7BCN0 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm28048F7BCN0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Gm28048F7BCN0 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Gm28048F7BCN0 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Gm28048F7BCN0 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Gm28048F7BCN0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm28048F7BCN0 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm28048F7BCN0 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm28048F7BCN0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Gm28048F7BCN0 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gm28048F7BCN0 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Gm28048F7BCN0 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Gm28048F7BCN0 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm28048F7BCN0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm28048F7BCN0 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Gm28048F7BCN0 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm28048F7BCN0 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm28048F7BCN0 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm28048F7BCN0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm28048F7BCN0 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm28048F7BCN0 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm28048F7BCN0 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Gm28048F7BCN0 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm28048F7BCN0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm28048F7BCN0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
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Gm28048F7BCN0 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Gm28048F7BCN0 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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