Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc7bE9Q9Y3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc7bE9Q9Y3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc7bE9Q9Y3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc7bE9Q9Y3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc7bE9Q9Y3 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc7bE9Q9Y3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc7bE9Q9Y3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc7bE9Q9Y3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc7bE9Q9Y3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc7bE9Q9Y3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc7bE9Q9Y3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc7bE9Q9Y3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc7bE9Q9Y3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc7bE9Q9Y3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc7bE9Q9Y3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc7bE9Q9Y3 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc7bE9Q9Y3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc7bE9Q9Y3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc7bE9Q9Y3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc7bE9Q9Y3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc7bE9Q9Y3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc7bE9Q9Y3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc7bE9Q9Y3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc7bE9Q9Y3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc7bE9Q9Y3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc7bE9Q9Y3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc7bE9Q9Y3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc7bE9Q9Y3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc7bE9Q9Y3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc7bE9Q9Y3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc7bE9Q9Y3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc7bE9Q9Y3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc7bE9Q9Y3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc7bE9Q9Y3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc7bE9Q9Y3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc7bE9Q9Y3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc7bE9Q9Y3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc7bE9Q9Y3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc7bE9Q9Y3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc7bE9Q9Y3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc7bE9Q9Y3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc7bE9Q9Y3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc7bE9Q9Y3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc7bE9Q9Y3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc7bE9Q9Y3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc7bE9Q9Y3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc7bE9Q9Y3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc7bE9Q9Y3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc7bE9Q9Y3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc7bE9Q9Y3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccdc7bE9Q9Y3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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