Protein–RNA interactions for Protein: E9PW72

Gm3002, Predicted gene 3002, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3002E9PW72 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm3002E9PW72 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm3002E9PW72 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm3002E9PW72 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm3002E9PW72 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm3002E9PW72 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm3002E9PW72 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm3002E9PW72 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm3002E9PW72 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm3002E9PW72 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm3002E9PW72 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm3002E9PW72 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm3002E9PW72 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm3002E9PW72 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm3002E9PW72 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm3002E9PW72 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm3002E9PW72 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm3002E9PW72 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm3002E9PW72 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm3002E9PW72 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm3002E9PW72 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm3002E9PW72 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm3002E9PW72 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm3002E9PW72 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm3002E9PW72 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm3002E9PW72 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm3002E9PW72 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm3002E9PW72 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm3002E9PW72 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm3002E9PW72 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm3002E9PW72 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm3002E9PW72 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm3002E9PW72 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm3002E9PW72 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm3002E9PW72 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm3002E9PW72 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm3002E9PW72 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm3002E9PW72 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm3002E9PW72 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm3002E9PW72 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm3002E9PW72 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm3002E9PW72 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm3002E9PW72 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm3002E9PW72 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm3002E9PW72 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm3002E9PW72 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm3002E9PW72 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm3002E9PW72 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm3002E9PW72 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm3002E9PW72 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm3002E9PW72 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm3002E9PW72 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gm3002E9PW72 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm3002E9PW72 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm3002E9PW72 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm3002E9PW72 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm3002E9PW72 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm3002E9PW72 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm3002E9PW72 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm3002E9PW72 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm3002E9PW72 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm3002E9PW72 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm3002E9PW72 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm3002E9PW72 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm3002E9PW72 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm3002E9PW72 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm3002E9PW72 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm3002E9PW72 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm3002E9PW72 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm3002E9PW72 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm3002E9PW72 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm3002E9PW72 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm3002E9PW72 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm3002E9PW72 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm3002E9PW72 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm3002E9PW72 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm3002E9PW72 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm3002E9PW72 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm3002E9PW72 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm3002E9PW72 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm3002E9PW72 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm3002E9PW72 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm3002E9PW72 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm3002E9PW72 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm3002E9PW72 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm3002E9PW72 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm3002E9PW72 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm3002E9PW72 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm3002E9PW72 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm3002E9PW72 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm3002E9PW72 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm3002E9PW72 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm3002E9PW72 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm3002E9PW72 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm3002E9PW72 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm3002E9PW72 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm3002E9PW72 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm3002E9PW72 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm3002E9PW72 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gm3002E9PW72 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms