Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 CT030182.2-201ENSMUST00000223569 620 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Sptan1P16546 AC154767.2-201ENSMUST00000224584 414 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Sptan1P16546 Olfr1406-201ENSMUST00000072395 1063 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Sptan1P16546 Gm24200-201ENSMUST00000082955 157 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Sptan1P16546 Vmn1r22-203ENSMUST00000228076 3011 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Sptan1P16546 Rabep1-202ENSMUST00000081362 2469 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Sptan1P16546 Gm43190-201ENSMUST00000187850 1779 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Sptan1P16546 Gm19272-202ENSMUST00000185181 2217 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Sptan1P16546 Sis-201ENSMUST00000094190 5887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Sptan1P16546 Olfr1346-203ENSMUST00000215302 4525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Sptan1P16546 Olfr1443-203ENSMUST00000215134 3995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Sptan1P16546 Kif18a-201ENSMUST00000028527 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Sptan1P16546 Gm9877-201ENSMUST00000064271 2627 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Sptan1P16546 Clmn-201ENSMUST00000109936 11866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Sptan1P16546 A730017C20Rik-201ENSMUST00000058633 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Sptan1P16546 Actr6-201ENSMUST00000020109 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Sptan1P16546 AC115289.2-201ENSMUST00000223836 2803 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Sptan1P16546 Prelp-201ENSMUST00000048432 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Sptan1P16546 Gm14294-201ENSMUST00000119749 751 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Sptan1P16546 Gm25655-201ENSMUST00000158465 290 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Sptan1P16546 Vmn1r-ps11-201ENSMUST00000176097 853 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Sptan1P16546 Gm5624-202ENSMUST00000178184 492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Sptan1P16546 Gm30262-201ENSMUST00000219137 791 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Sptan1P16546 AC154481.1-201ENSMUST00000223532 331 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Sptan1P16546 AC156016.5-201ENSMUST00000228742 355 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
Sptan1P16546 Olfr556-201ENSMUST00000098219 1023 ntAPPRIS P1 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Sptan1P16546 Atf2-202ENSMUST00000090802 4016 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
Sptan1P16546 Ccl28-201ENSMUST00000099241 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
Sptan1P16546 Gm37022-201ENSMUST00000192517 2254 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Sptan1P16546 Acsm2-207ENSMUST00000167935 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Sptan1P16546 Olfr202-203ENSMUST00000217485 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Sptan1P16546 Trp63-205ENSMUST00000115306 4691 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Sptan1P16546 Olfr90-206ENSMUST00000217397 2680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Sptan1P16546 Gm28109-201ENSMUST00000189979 2167 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Sptan1P16546 Olfr531-204ENSMUST00000217167 3874 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Sptan1P16546 Dock7-214ENSMUST00000205650 6297 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Sptan1P16546 9630028B13Rik-201ENSMUST00000143787 3406 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Sptan1P16546 Olfr1440-202ENSMUST00000213657 7588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Sptan1P16546 Olfr1032-202ENSMUST00000079298 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Sptan1P16546 Ceacam13-202ENSMUST00000108488 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Sptan1P16546 Mptx2-201ENSMUST00000111224 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Sptan1P16546 Rab26os-201ENSMUST00000176215 477 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Sptan1P16546 Mir6343-201ENSMUST00000183584 84 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Sptan1P16546 Olfr1215-201ENSMUST00000188399 943 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Sptan1P16546 Gm28640-201ENSMUST00000190918 550 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Sptan1P16546 Gm6543-201ENSMUST00000197353 808 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Sptan1P16546 AC174780.1-201ENSMUST00000199415 1107 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Sptan1P16546 Gm18100-201ENSMUST00000200897 452 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Sptan1P16546 Gm4548-201ENSMUST00000208487 509 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Sptan1P16546 CAAA01216754.4-202ENSMUST00000215276 610 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Sptan1P16546 CAAA01216754.4-203ENSMUST00000217178 1097 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Sptan1P16546 Gm20368-201ENSMUST00000220716 301 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Sptan1P16546 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Sptan1P16546 Cd160-201ENSMUST00000047702 1121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Sptan1P16546 Mir30b-201ENSMUST00000083542 96 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Sptan1P16546 Rpl23a-ps1-201ENSMUST00000085632 465 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Sptan1P16546 Lats1-203ENSMUST00000217931 4186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Sptan1P16546 Olfr449-204ENSMUST00000214687 1921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Sptan1P16546 Cyp2c65-201ENSMUST00000087236 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Sptan1P16546 Pcdh15-217ENSMUST00000134009 3300 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Sptan1P16546 Depdc1a-202ENSMUST00000106041 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Sptan1P16546 Cntnap5a-201ENSMUST00000043725 10945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Sptan1P16546 Naip5-201ENSMUST00000049789 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Sptan1P16546 Dnah3-204ENSMUST00000209154 12265 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Sptan1P16546 Tial1-211ENSMUST00000165023 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Sptan1P16546 Clasp1-202ENSMUST00000070989 7767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Sptan1P16546 AC122881.1-201ENSMUST00000225757 2695 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Sptan1P16546 Pramel7-201ENSMUST00000026957 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Sptan1P16546 Folh1-202ENSMUST00000107271 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Sptan1P16546 Gm37690-202ENSMUST00000192684 1497 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Sptan1P16546 Gm6081-201ENSMUST00000134472 489 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Sptan1P16546 Sspnos-201ENSMUST00000139089 826 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Sptan1P16546 Gm14505-201ENSMUST00000145383 831 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Sptan1P16546 Olfr760-ps1-201ENSMUST00000172563 748 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Sptan1P16546 Gm17981-201ENSMUST00000191109 739 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Sptan1P16546 Gm42720-201ENSMUST00000196813 300 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Sptan1P16546 Psma4-201ENSMUST00000034848 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Sptan1P16546 Olfr1359-201ENSMUST00000077843 991 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Sptan1P16546 Rorb-201ENSMUST00000040153 8759 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Sptan1P16546 Gm3883-201ENSMUST00000098119 3229 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Sptan1P16546 Adgrl3-203ENSMUST00000117253 4764 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Sptan1P16546 Mipol1-208ENSMUST00000153137 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Sptan1P16546 Hgf-203ENSMUST00000196645 2189 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Sptan1P16546 Olfr535-203ENSMUST00000213715 5033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Sptan1P16546 Scyl3-203ENSMUST00000161908 3718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Sptan1P16546 Gm15880-201ENSMUST00000142678 2884 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Sptan1P16546 Cped1-202ENSMUST00000115383 5690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Sptan1P16546 Olfr1426-205ENSMUST00000219155 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Sptan1P16546 Zfp799-205ENSMUST00000202988 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Sptan1P16546 Vrk2-202ENSMUST00000109504 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Sptan1P16546 F930017D23Rik-202ENSMUST00000213342 2141 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Sptan1P16546 Olfr701-201ENSMUST00000075414 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Sptan1P16546 Prom1-205ENSMUST00000165909 4089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Sptan1P16546 Scn9a-203ENSMUST00000112354 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Sptan1P16546 Cxcr6-202ENSMUST00000216072 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Sptan1P16546 Gm26538-201ENSMUST00000180512 3498 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Sptan1P16546 Trpm3-203ENSMUST00000087576 6740 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Sptan1P16546 Vcam1-203ENSMUST00000196449 2532 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Sptan1P16546 Pdlim5-205ENSMUST00000170361 2010 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Sptan1P16546 Gm13077-201ENSMUST00000121941 484 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms