Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ11

Chsy1, Chondroitin sulfate synthase 1, mousemouse

Predictions only

Length 800 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy1Q6ZQ11 Trpm3-203ENSMUST00000087576 6740 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Chsy1Q6ZQ11 Pou2f1-205ENSMUST00000111427 13050 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
Chsy1Q6ZQ11 1500004A13Rik-203ENSMUST00000183966 3743 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Chsy1Q6ZQ11 Gm26707-201ENSMUST00000181552 3902 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Chsy1Q6ZQ11 Gm38335-201ENSMUST00000195727 1789 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Chsy1Q6ZQ11 Gm43113-201ENSMUST00000199713 1754 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Chsy1Q6ZQ11 Zranb3-201ENSMUST00000086614 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
Chsy1Q6ZQ11 Rasgrp3-202ENSMUST00000164192 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Chsy1Q6ZQ11 Olfr1170-202ENSMUST00000214386 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Chsy1Q6ZQ11 CT009696.4-202ENSMUST00000213560 2248 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Chsy1Q6ZQ11 Gm37943-201ENSMUST00000194053 3944 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Chsy1Q6ZQ11 Trmt10a-201ENSMUST00000040321 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Chsy1Q6ZQ11 Vmn2r2-201ENSMUST00000077958 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Chsy1Q6ZQ11 Cntnap5a-201ENSMUST00000043725 10945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Chsy1Q6ZQ11 Ugt2a1-201ENSMUST00000147854 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Chsy1Q6ZQ11 Nr3c1-204ENSMUST00000115571 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Chsy1Q6ZQ11 Synj2bp-203ENSMUST00000163402 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Chsy1Q6ZQ11 Rfc1-203ENSMUST00000203581 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Chsy1Q6ZQ11 Gm10826-201ENSMUST00000215366 3304 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Chsy1Q6ZQ11 Zfp27-202ENSMUST00000159920 3381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Chsy1Q6ZQ11 Gm25795-201ENSMUST00000104421 132 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Chsy1Q6ZQ11 Gm22953-201ENSMUST00000116724 101 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Chsy1Q6ZQ11 Gm11617-201ENSMUST00000119609 639 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Chsy1Q6ZQ11 Gm14294-201ENSMUST00000119749 751 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Chsy1Q6ZQ11 Gm12066-201ENSMUST00000123592 443 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Chsy1Q6ZQ11 Gm12923-201ENSMUST00000127060 667 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Chsy1Q6ZQ11 Gm12107-201ENSMUST00000132857 889 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Chsy1Q6ZQ11 Gm26346-201ENSMUST00000157525 329 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Chsy1Q6ZQ11 Gm26410-201ENSMUST00000157670 261 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Chsy1Q6ZQ11 Hspe1-ps3-201ENSMUST00000172726 277 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Chsy1Q6ZQ11 Scarletltr-201ENSMUST00000176950 305 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Chsy1Q6ZQ11 Gm17048-201ENSMUST00000179266 847 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Chsy1Q6ZQ11 Gm27240-201ENSMUST00000183616 677 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Chsy1Q6ZQ11 A630095E13Rik-202ENSMUST00000184611 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Chsy1Q6ZQ11 Gm28492-201ENSMUST00000190899 1019 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Chsy1Q6ZQ11 Gm28777-201ENSMUST00000191402 535 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Chsy1Q6ZQ11 Gm8009-201ENSMUST00000191672 436 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Chsy1Q6ZQ11 Gm37502-201ENSMUST00000192981 356 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Chsy1Q6ZQ11 1700015C17Rik-201ENSMUST00000197297 239 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Chsy1Q6ZQ11 Gm43561-201ENSMUST00000199866 448 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Chsy1Q6ZQ11 Gm20426-202ENSMUST00000204789 399 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Chsy1Q6ZQ11 Gm4083-201ENSMUST00000207158 451 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Chsy1Q6ZQ11 CT009748.2-201ENSMUST00000213828 1082 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Chsy1Q6ZQ11 Gm34263-202ENSMUST00000214353 303 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Chsy1Q6ZQ11 AC113082.2-201ENSMUST00000215876 756 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Chsy1Q6ZQ11 AC132384.8-201ENSMUST00000218152 1204 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Chsy1Q6ZQ11 Gm46332-202ENSMUST00000220320 516 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Chsy1Q6ZQ11 AC073562.1-201ENSMUST00000222117 401 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Chsy1Q6ZQ11 AC163743.1-201ENSMUST00000224309 270 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Chsy1Q6ZQ11 Olfr25-202ENSMUST00000212354 1362 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Chsy1Q6ZQ11 Slc35a5-201ENSMUST00000023344 4233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Chsy1Q6ZQ11 Gm9521-201ENSMUST00000206656 1516 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Chsy1Q6ZQ11 D830032E09Rik-202ENSMUST00000189497 1632 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Chsy1Q6ZQ11 Gm31218-202ENSMUST00000221428 1823 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Chsy1Q6ZQ11 Pkn2-206ENSMUST00000173830 2808 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Chsy1Q6ZQ11 Gm38085-201ENSMUST00000195785 3062 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Chsy1Q6ZQ11 Acad11-202ENSMUST00000120854 3108 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Chsy1Q6ZQ11 Ano5-202ENSMUST00000207044 3311 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Chsy1Q6ZQ11 Akap11-202ENSMUST00000123853 9364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Chsy1Q6ZQ11 Chd6-201ENSMUST00000039782 10515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Chsy1Q6ZQ11 Adgrg2-202ENSMUST00000112400 4682 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Chsy1Q6ZQ11 Rasgrp3-201ENSMUST00000095204 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Chsy1Q6ZQ11 Olfr430-203ENSMUST00000214390 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Chsy1Q6ZQ11 Adam21-201ENSMUST00000008582 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Chsy1Q6ZQ11 Grin2b-201ENSMUST00000053880 24060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Chsy1Q6ZQ11 Ubtfl1-202ENSMUST00000164441 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Chsy1Q6ZQ11 4933402E13Rik-202ENSMUST00000178085 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Chsy1Q6ZQ11 AC164107.1-202ENSMUST00000228953 1816 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Chsy1Q6ZQ11 C530043A13Rik-202ENSMUST00000188155 1512 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Chsy1Q6ZQ11 4921524L21Rik-201ENSMUST00000044829 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Chsy1Q6ZQ11 Gm12794-201ENSMUST00000052027 1452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Chsy1Q6ZQ11 Samd8-202ENSMUST00000119430 6801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Chsy1Q6ZQ11 Sgms1-209ENSMUST00000142618 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Chsy1Q6ZQ11 Sec61g-202ENSMUST00000109642 691 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Chsy1Q6ZQ11 Gm13193-201ENSMUST00000117275 225 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Chsy1Q6ZQ11 Fam229b-202ENSMUST00000124941 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Chsy1Q6ZQ11 Gm14325-202ENSMUST00000150650 310 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Chsy1Q6ZQ11 Gm25387-201ENSMUST00000157813 132 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Chsy1Q6ZQ11 Gm26238-201ENSMUST00000175538 117 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Chsy1Q6ZQ11 B230110C06Rik-202ENSMUST00000181936 938 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Chsy1Q6ZQ11 Spata17-208ENSMUST00000184543 667 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Chsy1Q6ZQ11 Gm28237-201ENSMUST00000186563 641 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Chsy1Q6ZQ11 Scgb1b4-ps-201ENSMUST00000186920 271 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Chsy1Q6ZQ11 1700110C19Rik-202ENSMUST00000188715 717 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Chsy1Q6ZQ11 Gm18799-201ENSMUST00000189104 913 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Chsy1Q6ZQ11 Gm29587-201ENSMUST00000189898 332 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Chsy1Q6ZQ11 Ighv5-3-201ENSMUST00000195336 322 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Chsy1Q6ZQ11 Gm5306-201ENSMUST00000203325 757 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Chsy1Q6ZQ11 1700093K21Rik-201ENSMUST00000020527 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Chsy1Q6ZQ11 Gm7570-201ENSMUST00000215246 698 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Chsy1Q6ZQ11 AC156559.2-201ENSMUST00000224403 384 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Chsy1Q6ZQ11 Lcn9-201ENSMUST00000023978 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Chsy1Q6ZQ11 Olfr678-201ENSMUST00000098160 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Chsy1Q6ZQ11 Olfr548-ps1-201ENSMUST00000098228 933 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Chsy1Q6ZQ11 AC160029.1-201ENSMUST00000219628 2678 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Chsy1Q6ZQ11 Gm31822-201ENSMUST00000216096 2572 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Chsy1Q6ZQ11 Gm12324-201ENSMUST00000130837 3753 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Chsy1Q6ZQ11 Ccdc38-203ENSMUST00000132214 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Chsy1Q6ZQ11 Map2-201ENSMUST00000024639 5195 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Chsy1Q6ZQ11 Gm20075-201ENSMUST00000220449 2161 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms