Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 1700091H14Rik-201ENSMUST00000167772 590 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20617-201ENSMUST00000177082 717 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gm25873-201ENSMUST00000180317 107 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gm34068-201ENSMUST00000193310 632 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 C920008G01Rik-201ENSMUST00000196756 380 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Trav7-1-201ENSMUST00000198019 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5990-201ENSMUST00000203126 746 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45181-201ENSMUST00000207878 449 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44743-201ENSMUST00000209062 386 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45274-201ENSMUST00000209938 647 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7540-201ENSMUST00000219764 926 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 4930567K20Rik-204ENSMUST00000220270 445 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 AC159649.1-201ENSMUST00000220851 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 AC116502.1-201ENSMUST00000220989 291 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gm7086-202ENSMUST00000228849 506 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Ropn1-201ENSMUST00000023530 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 4930522N08Rik-201ENSMUST00000031274 916 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42856-201ENSMUST00000200848 2852 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Vti1a-202ENSMUST00000223690 4175 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Rasgrf2-201ENSMUST00000099326 3567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Plekha6-202ENSMUST00000105082 7085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Synpo2-203ENSMUST00000106427 6937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Rab44-201ENSMUST00000087942 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gramd4-201ENSMUST00000088931 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Zscan21-205ENSMUST00000110961 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Elmo2-205ENSMUST00000103091 4695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Eapp-204ENSMUST00000161592 4186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Adcy9-202ENSMUST00000117801 4507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gle1-201ENSMUST00000019859 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Tfap2b-201ENSMUST00000027059 5863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Clip1-201ENSMUST00000031382 4387 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Smchd1-201ENSMUST00000127430 7052 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp74-201ENSMUST00000032797 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Spn-201ENSMUST00000049931 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44874-201ENSMUST00000206586 1542 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Bach2-207ENSMUST00000171600 8493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Khdc1b-201ENSMUST00000147615 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Vill-201ENSMUST00000051386 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn2r54-201ENSMUST00000086210 2421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Lrit2-201ENSMUST00000057176 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Hbp1-202ENSMUST00000172314 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Def8-202ENSMUST00000065534 3127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp970-202ENSMUST00000108952 1569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Pde8b-210ENSMUST00000162412 4035 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Mapre2-201ENSMUST00000025127 4026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 Rbms2-202ENSMUST00000099139 3302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gtpbp6Q3U6U5 4933406G16Rik-201ENSMUST00000144854 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15232-201ENSMUST00000146929 2318 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Cdip1-201ENSMUST00000004173 3953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28333-201ENSMUST00000186034 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28704-201ENSMUST00000186589 2169 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29636-201ENSMUST00000188149 2169 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28839-201ENSMUST00000189579 2171 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29612-201ENSMUST00000191490 2168 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Gm24986-201ENSMUST00000104452 132 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13682-201ENSMUST00000117524 702 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Mup12-201ENSMUST00000117932 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14901-201ENSMUST00000119001 283 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13170-201ENSMUST00000119716 643 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Gm14605-201ENSMUST00000120599 268 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 4930597A21Rik-201ENSMUST00000128652 698 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Babam2-205ENSMUST00000131995 1220 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Gm22948-201ENSMUST00000158561 243 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17364-201ENSMUST00000163881 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Gm17430-201ENSMUST00000171339 474 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Mir6769b-201ENSMUST00000184793 60 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29120-201ENSMUST00000186111 696 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Gm21840-201ENSMUST00000187212 696 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29420-201ENSMUST00000187261 694 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Gm21848-201ENSMUST00000187722 696 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29623-201ENSMUST00000188316 696 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 1700036G14Rik-201ENSMUST00000189046 542 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Gm21841-201ENSMUST00000189958 696 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Gm21757-201ENSMUST00000191075 696 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28946-201ENSMUST00000191176 696 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Igkv15-102-201ENSMUST00000197885 287 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Kap-202ENSMUST00000203168 464 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44987-201ENSMUST00000206578 750 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Gm21885-202ENSMUST00000208510 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45368-202ENSMUST00000210944 416 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Gm31045-201ENSMUST00000211266 922 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 AC192091.1-201ENSMUST00000218668 439 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Zp4-ps-202ENSMUST00000222293 922 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 AC117656.1-201ENSMUST00000225826 339 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Defb13-201ENSMUST00000060587 452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26447-201ENSMUST00000082448 129 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Gm25482-201ENSMUST00000083225 107 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Mup8-201ENSMUST00000095058 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Eftud2-201ENSMUST00000021306 3324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Cd99l2-202ENSMUST00000080035 3327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 C79130-201ENSMUST00000199610 4296 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp445-206ENSMUST00000216063 6189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 4930442L01Rik-201ENSMUST00000145865 2077 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Acox3-202ENSMUST00000068947 3976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Gatad2b-205ENSMUST00000199754 7438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6502-201ENSMUST00000086050 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Pcdh15-236ENSMUST00000193174 5936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Hdhd2-207ENSMUST00000147332 1705 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Mtm1-206ENSMUST00000114621 3257 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28444-201ENSMUST00000190777 2137 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.6 ms