Protein–RNA interactions for Protein: Q149B8

Perm1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 807 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Perm1Q149B8 Sec24a-201ENSMUST00000038210 3800 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Perm1Q149B8 Olfr148-201ENSMUST00000050807 1017 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Perm1Q149B8 A530021J07Rik-201ENSMUST00000066005 414 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Perm1Q149B8 Olfr726-201ENSMUST00000072370 966 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Perm1Q149B8 Noc3l-201ENSMUST00000025963 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Perm1Q149B8 Lrrc40-201ENSMUST00000072080 4142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Perm1Q149B8 Gm43022-201ENSMUST00000197067 4268 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Perm1Q149B8 Gm20121-201ENSMUST00000198547 1594 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Perm1Q149B8 Nxpe4-203ENSMUST00000216998 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Perm1Q149B8 Prkaa1-201ENSMUST00000051186 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Perm1Q149B8 Olfr961-202ENSMUST00000219295 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Perm1Q149B8 Olfr726-205ENSMUST00000215278 1324 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Perm1Q149B8 CT009604.1-201ENSMUST00000223900 1328 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
Perm1Q149B8 Olfr1283-202ENSMUST00000204064 1625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Perm1Q149B8 Cd44-201ENSMUST00000005218 5614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Perm1Q149B8 Trim60-201ENSMUST00000048565 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Perm1Q149B8 Gm37915-201ENSMUST00000195134 3261 ntTSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Perm1Q149B8 Pum2-216ENSMUST00000178015 5874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
Perm1Q149B8 Phc3-206ENSMUST00000129817 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Perm1Q149B8 Gm6494-201ENSMUST00000218604 2298 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
Perm1Q149B8 Ighd-202ENSMUST00000194162 1806 ntAPPRIS P5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
Perm1Q149B8 Actl11-201ENSMUST00000085073 3993 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.33
Perm1Q149B8 Ripk1-203ENSMUST00000167374 6472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Perm1Q149B8 Lncenc1-202ENSMUST00000179324 2764 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.33
Perm1Q149B8 3110043O21Rik-202ENSMUST00000108126 2644 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Perm1Q149B8 Efcab14-201ENSMUST00000074425 4300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Perm1Q149B8 Plce1-201ENSMUST00000169713 9439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Perm1Q149B8 Ttf1-201ENSMUST00000100237 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
Perm1Q149B8 Zfp599-201ENSMUST00000086281 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Perm1Q149B8 4933424H11Rik-201ENSMUST00000200511 2018 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
Perm1Q149B8 AC154627.2-201ENSMUST00000227028 4669 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
Perm1Q149B8 Zbtb6-201ENSMUST00000053098 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Perm1Q149B8 Gm37142-201ENSMUST00000193718 3110 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Perm1Q149B8 Olfr976-201ENSMUST00000169307 2813 ntAPPRIS P2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Perm1Q149B8 Abcb11-202ENSMUST00000102710 4893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Perm1Q149B8 Gm43549-201ENSMUST00000198856 2661 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Perm1Q149B8 Phc3-204ENSMUST00000108255 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Perm1Q149B8 Igkv18-36-201ENSMUST00000103373 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Perm1Q149B8 Gm24340-201ENSMUST00000104208 97 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Perm1Q149B8 Ccdc7b-203ENSMUST00000108745 1047 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Perm1Q149B8 Gm12392-201ENSMUST00000118014 938 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Perm1Q149B8 Gm12670-201ENSMUST00000123606 576 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Perm1Q149B8 2310044K18Rik-201ENSMUST00000125131 618 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Perm1Q149B8 Gm12092-201ENSMUST00000125194 600 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Perm1Q149B8 Gm13874-201ENSMUST00000130680 809 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Perm1Q149B8 Gm25722-201ENSMUST00000157498 279 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Perm1Q149B8 Gm25374-201ENSMUST00000158158 101 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Perm1Q149B8 Gm25717-201ENSMUST00000158631 353 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Perm1Q149B8 Gm24733-201ENSMUST00000158863 253 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Perm1Q149B8 1700129C05Rik-203ENSMUST00000162271 325 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Perm1Q149B8 Gm10074-201ENSMUST00000174543 249 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Perm1Q149B8 Ighv2-6-201ENSMUST00000179657 350 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Perm1Q149B8 Gm28706-201ENSMUST00000186830 355 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Perm1Q149B8 Gm28962-201ENSMUST00000187993 621 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Perm1Q149B8 Gm28692-202ENSMUST00000189645 621 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Perm1Q149B8 Gm37740-202ENSMUST00000194757 621 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Perm1Q149B8 Gm43725-201ENSMUST00000200122 369 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Perm1Q149B8 Gm44088-201ENSMUST00000204595 237 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Perm1Q149B8 AC123835.1-201ENSMUST00000214362 670 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Perm1Q149B8 Gm4510-201ENSMUST00000218265 427 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Perm1Q149B8 AC163621.2-201ENSMUST00000222229 682 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Perm1Q149B8 AC132881.2-201ENSMUST00000225474 709 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Perm1Q149B8 AC156790.1-201ENSMUST00000226572 559 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Perm1Q149B8 1700007K09Rik-201ENSMUST00000033146 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Perm1Q149B8 Mmp12-202ENSMUST00000065079 1185 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Perm1Q149B8 Ccr1l1-201ENSMUST00000071404 1166 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Perm1Q149B8 Olfr846-201ENSMUST00000078774 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Perm1Q149B8 Gm26072-201ENSMUST00000083135 107 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Perm1Q149B8 Olfr661-201ENSMUST00000098168 964 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Perm1Q149B8 Gm37525-201ENSMUST00000193499 2871 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Perm1Q149B8 Clcn5-201ENSMUST00000004428 8390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Perm1Q149B8 Gm38218-201ENSMUST00000193555 4689 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Perm1Q149B8 Pomp-202ENSMUST00000201120 3850 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Perm1Q149B8 Bbs12-201ENSMUST00000057975 2433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Perm1Q149B8 Ift80-202ENSMUST00000107812 4063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Perm1Q149B8 Emsy-202ENSMUST00000205276 7693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Perm1Q149B8 Gm38178-201ENSMUST00000194502 2471 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Perm1Q149B8 Gm15394-201ENSMUST00000119656 1308 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Perm1Q149B8 AC158388.2-201ENSMUST00000223665 1314 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Perm1Q149B8 Slc26a7-201ENSMUST00000042221 5165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Perm1Q149B8 Ezh1-203ENSMUST00000107285 4193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Perm1Q149B8 BC046251-201ENSMUST00000154632 3653 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Perm1Q149B8 Skiv2l2-201ENSMUST00000022281 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Perm1Q149B8 B020004J07Rik-201ENSMUST00000084386 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Perm1Q149B8 Nasp-201ENSMUST00000030456 2520 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Perm1Q149B8 Gm42827-201ENSMUST00000197058 1515 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Perm1Q149B8 Osbpl9-216ENSMUST00000161363 2356 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Perm1Q149B8 Gm6882-202ENSMUST00000207192 2365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Perm1Q149B8 Gcnt2-202ENSMUST00000069958 3929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Perm1Q149B8 Cacnb4-203ENSMUST00000102761 8039 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Perm1Q149B8 Gm42636-201ENSMUST00000197174 2239 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Perm1Q149B8 Gm21123-201ENSMUST00000210822 1734 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Perm1Q149B8 6720475M21Rik-201ENSMUST00000201755 2753 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Perm1Q149B8 Mapk10-202ENSMUST00000112846 2617 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Perm1Q149B8 Gm42609-201ENSMUST00000196362 3306 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Perm1Q149B8 Odf2l-203ENSMUST00000098539 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Perm1Q149B8 Tdrkh-207ENSMUST00000197901 2652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Perm1Q149B8 Arhgap6-203ENSMUST00000112127 3973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Perm1Q149B8 Pcdh15-211ENSMUST00000126920 6866 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Perm1Q149B8 Igkv9-120-201ENSMUST00000103316 353 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms