Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Hdlbp-201ENSMUST00000042498 4427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Hoxb4P10284 Brpf1-201ENSMUST00000113117 4540 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxb4P10284 Obox3-206ENSMUST00000174443 1979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxb4P10284 Npnt-201ENSMUST00000042729 3601 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxb4P10284 Cldn1-201ENSMUST00000023154 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxb4P10284 Ank3-206ENSMUST00000092434 5886 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxb4P10284 Hnrnpc-207ENSMUST00000227536 1301 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxb4P10284 Schip1-207ENSMUST00000182997 1557 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxb4P10284 Gm15169-202ENSMUST00000130794 2335 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxb4P10284 Muc20-202ENSMUST00000115116 3673 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxb4P10284 Olfr1232-202ENSMUST00000213860 2413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxb4P10284 Trim2-205ENSMUST00000107693 5755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxb4P10284 Pde8b-210ENSMUST00000162412 4035 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxb4P10284 Espl1-201ENSMUST00000064924 6630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxb4P10284 Gbp2-201ENSMUST00000165774 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxb4P10284 Cacna1c-220ENSMUST00000189520 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxb4P10284 Fanca-201ENSMUST00000035495 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxb4P10284 Psmb11-201ENSMUST00000097177 4247 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxb4P10284 Clstn3-202ENSMUST00000112523 3703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxb4P10284 Trak2-205ENSMUST00000174120 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxb4P10284 Gm42520-201ENSMUST00000199642 1502 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxb4P10284 Trav6-2-201ENSMUST00000103573 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxb4P10284 Uros-202ENSMUST00000106144 1045 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxb4P10284 Gm14777-201ENSMUST00000116306 176 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxb4P10284 Mir669e-201ENSMUST00000117003 119 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxb4P10284 Gm14529-201ENSMUST00000117894 406 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxb4P10284 Gm6744-201ENSMUST00000119303 543 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxb4P10284 Gm16511-201ENSMUST00000120019 564 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxb4P10284 Gm6689-201ENSMUST00000130905 481 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxb4P10284 Gm12259-201ENSMUST00000138391 328 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxb4P10284 Gm23258-201ENSMUST00000158319 106 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxb4P10284 Gm7244-201ENSMUST00000164658 455 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxb4P10284 Mir5625-201ENSMUST00000176598 80 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxb4P10284 Gm18006-201ENSMUST00000177411 662 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxb4P10284 Gm21762-201ENSMUST00000177561 456 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxb4P10284 Tdgf1-ps1-201ENSMUST00000179882 516 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxb4P10284 Trav6d-5-201ENSMUST00000180687 338 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxb4P10284 Gm26871-203ENSMUST00000181060 355 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxb4P10284 Rnf170-ps-201ENSMUST00000181188 859 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxb4P10284 Gm8204-201ENSMUST00000185696 2144 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxb4P10284 Gm29134-201ENSMUST00000186579 126 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxb4P10284 Gm17929-201ENSMUST00000186851 627 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxb4P10284 1700016L21Rik-201ENSMUST00000187497 394 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxb4P10284 Gm17847-201ENSMUST00000188261 1127 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxb4P10284 Gm28241-201ENSMUST00000190916 235 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxb4P10284 Gm38183-201ENSMUST00000193189 205 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxb4P10284 Ighv3-7-201ENSMUST00000193370 348 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxb4P10284 Gm38167-201ENSMUST00000195704 1178 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxb4P10284 Gm9057-201ENSMUST00000198791 296 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxb4P10284 Gm39119-201ENSMUST00000208466 951 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxb4P10284 Gm45870-201ENSMUST00000211269 601 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxb4P10284 Gm3428-204ENSMUST00000214488 1020 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxb4P10284 Gm31432-201ENSMUST00000214727 538 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxb4P10284 4930549C15Rik-201ENSMUST00000221235 1260 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxb4P10284 CT030170.6-203ENSMUST00000222523 1295 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxb4P10284 AC154657.1-201ENSMUST00000226394 775 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxb4P10284 AC122251.1-201ENSMUST00000227717 639 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxb4P10284 AC154563.1-201ENSMUST00000228317 442 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxb4P10284 Tnfrsf1b-201ENSMUST00000030336 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxb4P10284 4930542C16Rik-201ENSMUST00000062438 1090 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxb4P10284 1700084J12Rik-201ENSMUST00000079057 734 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxb4P10284 Gm7978-202ENSMUST00000201129 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxb4P10284 BC061212-201ENSMUST00000094587 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxb4P10284 Lekr1-201ENSMUST00000099075 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxb4P10284 Tecta-203ENSMUST00000160940 7048 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxb4P10284 Anapc1-201ENSMUST00000014499 8942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxb4P10284 Gm5346-201ENSMUST00000056023 2326 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxb4P10284 Serpina3a-203ENSMUST00000185595 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxb4P10284 Ccdc86-201ENSMUST00000025639 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxb4P10284 Prn-202ENSMUST00000136783 3370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxb4P10284 Gm7435-202ENSMUST00000216003 2424 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxb4P10284 Kbtbd4-201ENSMUST00000090682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxb4P10284 Cacna1c-204ENSMUST00000112793 6669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxb4P10284 Gm14325-203ENSMUST00000188914 1494 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxb4P10284 Gm28173-201ENSMUST00000191190 1496 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxb4P10284 Gatad2b-203ENSMUST00000197988 1815 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxb4P10284 Gnl3l-202ENSMUST00000112691 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxb4P10284 Gnl3l-201ENSMUST00000026297 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxb4P10284 Mavs-201ENSMUST00000041362 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxb4P10284 Syt11-202ENSMUST00000107503 3575 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxb4P10284 Gm18289-201ENSMUST00000203356 2989 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxb4P10284 Olfr651-203ENSMUST00000216904 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxb4P10284 AC134596.1-201ENSMUST00000222016 1922 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxb4P10284 Gm5087-201ENSMUST00000060526 1921 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxb4P10284 AC132465.2-201ENSMUST00000218673 2728 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Hoxb4P10284 Tbc1d24-207ENSMUST00000171189 4592 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxb4P10284 Gm44228-201ENSMUST00000204888 2026 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxb4P10284 Actrt1-201ENSMUST00000059466 1339 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxb4P10284 Thsd1-201ENSMUST00000069828 4422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxb4P10284 Kdm4a-201ENSMUST00000050288 3279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxb4P10284 Ddx1-201ENSMUST00000071103 4842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxb4P10284 Gm15601-201ENSMUST00000122972 4033 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxb4P10284 Fam210a-201ENSMUST00000042852 9651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxb4P10284 Myo6-203ENSMUST00000113266 7632 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxb4P10284 Dysf-203ENSMUST00000113818 6571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxb4P10284 Olfr75-ps1-202ENSMUST00000141956 2500 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxb4P10284 Vmn2r50-202ENSMUST00000086298 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxb4P10284 D830032E09Rik-203ENSMUST00000189845 2092 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxb4P10284 Gm44255-201ENSMUST00000203456 2053 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Hoxb4P10284 Prickle2-201ENSMUST00000032093 7754 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms