Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm3550W4VSN7 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms