Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVK8

Cyp46a1, Cholesterol 24-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp46a1Q9WVK8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp46a1Q9WVK8 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp46a1Q9WVK8 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp46a1Q9WVK8 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp46a1Q9WVK8 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp46a1Q9WVK8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp46a1Q9WVK8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp46a1Q9WVK8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp46a1Q9WVK8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp46a1Q9WVK8 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp46a1Q9WVK8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp46a1Q9WVK8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp46a1Q9WVK8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp46a1Q9WVK8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp46a1Q9WVK8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp46a1Q9WVK8 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp46a1Q9WVK8 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp46a1Q9WVK8 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp46a1Q9WVK8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp46a1Q9WVK8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp46a1Q9WVK8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cyp46a1Q9WVK8 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp46a1Q9WVK8 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp46a1Q9WVK8 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp46a1Q9WVK8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp46a1Q9WVK8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp46a1Q9WVK8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp46a1Q9WVK8 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cyp46a1Q9WVK8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cyp46a1Q9WVK8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cyp46a1Q9WVK8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cyp46a1Q9WVK8 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cyp46a1Q9WVK8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cyp46a1Q9WVK8 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cyp46a1Q9WVK8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cyp46a1Q9WVK8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cyp46a1Q9WVK8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cyp46a1Q9WVK8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cyp46a1Q9WVK8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cyp46a1Q9WVK8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cyp46a1Q9WVK8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cyp46a1Q9WVK8 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Cyp46a1Q9WVK8 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cyp46a1Q9WVK8 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyp46a1Q9WVK8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyp46a1Q9WVK8 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyp46a1Q9WVK8 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyp46a1Q9WVK8 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyp46a1Q9WVK8 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyp46a1Q9WVK8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyp46a1Q9WVK8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyp46a1Q9WVK8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyp46a1Q9WVK8 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyp46a1Q9WVK8 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyp46a1Q9WVK8 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cyp46a1Q9WVK8 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyp46a1Q9WVK8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyp46a1Q9WVK8 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyp46a1Q9WVK8 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyp46a1Q9WVK8 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyp46a1Q9WVK8 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyp46a1Q9WVK8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyp46a1Q9WVK8 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cyp46a1Q9WVK8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp46a1Q9WVK8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp46a1Q9WVK8 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp46a1Q9WVK8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp46a1Q9WVK8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp46a1Q9WVK8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp46a1Q9WVK8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp46a1Q9WVK8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp46a1Q9WVK8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp46a1Q9WVK8 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp46a1Q9WVK8 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp46a1Q9WVK8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp46a1Q9WVK8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp46a1Q9WVK8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp46a1Q9WVK8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp46a1Q9WVK8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp46a1Q9WVK8 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp46a1Q9WVK8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp46a1Q9WVK8 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp46a1Q9WVK8 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp46a1Q9WVK8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cyp46a1Q9WVK8 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyp46a1Q9WVK8 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyp46a1Q9WVK8 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyp46a1Q9WVK8 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyp46a1Q9WVK8 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyp46a1Q9WVK8 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyp46a1Q9WVK8 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyp46a1Q9WVK8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyp46a1Q9WVK8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyp46a1Q9WVK8 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyp46a1Q9WVK8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyp46a1Q9WVK8 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyp46a1Q9WVK8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyp46a1Q9WVK8 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyp46a1Q9WVK8 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cyp46a1Q9WVK8 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms