Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV35

Apobec2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec2Q9WV35 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apobec2Q9WV35 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apobec2Q9WV35 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apobec2Q9WV35 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apobec2Q9WV35 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Apobec2Q9WV35 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apobec2Q9WV35 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apobec2Q9WV35 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Apobec2Q9WV35 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apobec2Q9WV35 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apobec2Q9WV35 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apobec2Q9WV35 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apobec2Q9WV35 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apobec2Q9WV35 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apobec2Q9WV35 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Apobec2Q9WV35 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Apobec2Q9WV35 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apobec2Q9WV35 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apobec2Q9WV35 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Apobec2Q9WV35 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apobec2Q9WV35 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apobec2Q9WV35 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apobec2Q9WV35 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Apobec2Q9WV35 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apobec2Q9WV35 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apobec2Q9WV35 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apobec2Q9WV35 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apobec2Q9WV35 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apobec2Q9WV35 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apobec2Q9WV35 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apobec2Q9WV35 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apobec2Q9WV35 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apobec2Q9WV35 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apobec2Q9WV35 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apobec2Q9WV35 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apobec2Q9WV35 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Apobec2Q9WV35 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apobec2Q9WV35 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apobec2Q9WV35 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apobec2Q9WV35 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apobec2Q9WV35 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apobec2Q9WV35 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apobec2Q9WV35 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apobec2Q9WV35 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apobec2Q9WV35 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Apobec2Q9WV35 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apobec2Q9WV35 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apobec2Q9WV35 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apobec2Q9WV35 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apobec2Q9WV35 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Apobec2Q9WV35 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apobec2Q9WV35 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apobec2Q9WV35 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apobec2Q9WV35 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apobec2Q9WV35 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apobec2Q9WV35 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Apobec2Q9WV35 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apobec2Q9WV35 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apobec2Q9WV35 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apobec2Q9WV35 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apobec2Q9WV35 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apobec2Q9WV35 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apobec2Q9WV35 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Apobec2Q9WV35 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Apobec2Q9WV35 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Apobec2Q9WV35 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Apobec2Q9WV35 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Apobec2Q9WV35 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Apobec2Q9WV35 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Apobec2Q9WV35 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Apobec2Q9WV35 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Apobec2Q9WV35 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Apobec2Q9WV35 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Apobec2Q9WV35 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Apobec2Q9WV35 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Apobec2Q9WV35 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Apobec2Q9WV35 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Apobec2Q9WV35 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Apobec2Q9WV35 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Apobec2Q9WV35 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Apobec2Q9WV35 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apobec2Q9WV35 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apobec2Q9WV35 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apobec2Q9WV35 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apobec2Q9WV35 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apobec2Q9WV35 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apobec2Q9WV35 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apobec2Q9WV35 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Apobec2Q9WV35 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Apobec2Q9WV35 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apobec2Q9WV35 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apobec2Q9WV35 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apobec2Q9WV35 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apobec2Q9WV35 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apobec2Q9WV35 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apobec2Q9WV35 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apobec2Q9WV35 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apobec2Q9WV35 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Apobec2Q9WV35 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Apobec2Q9WV35 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms