Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B9

Plod2, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod2Q9R0B9 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Plod2Q9R0B9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Plod2Q9R0B9 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Plod2Q9R0B9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Plod2Q9R0B9 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Plod2Q9R0B9 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Plod2Q9R0B9 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Plod2Q9R0B9 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Plod2Q9R0B9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Plod2Q9R0B9 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms