Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ25

Vnn3, Vascular non-inflammatory molecule 3, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vnn3Q9QZ25 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vnn3Q9QZ25 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vnn3Q9QZ25 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Vnn3Q9QZ25 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vnn3Q9QZ25 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vnn3Q9QZ25 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vnn3Q9QZ25 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vnn3Q9QZ25 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vnn3Q9QZ25 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vnn3Q9QZ25 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vnn3Q9QZ25 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Vnn3Q9QZ25 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vnn3Q9QZ25 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vnn3Q9QZ25 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vnn3Q9QZ25 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vnn3Q9QZ25 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vnn3Q9QZ25 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vnn3Q9QZ25 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vnn3Q9QZ25 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vnn3Q9QZ25 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vnn3Q9QZ25 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vnn3Q9QZ25 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vnn3Q9QZ25 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vnn3Q9QZ25 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Vnn3Q9QZ25 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vnn3Q9QZ25 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vnn3Q9QZ25 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vnn3Q9QZ25 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vnn3Q9QZ25 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Vnn3Q9QZ25 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vnn3Q9QZ25 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Vnn3Q9QZ25 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vnn3Q9QZ25 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vnn3Q9QZ25 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vnn3Q9QZ25 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vnn3Q9QZ25 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vnn3Q9QZ25 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vnn3Q9QZ25 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vnn3Q9QZ25 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vnn3Q9QZ25 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vnn3Q9QZ25 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Vnn3Q9QZ25 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vnn3Q9QZ25 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vnn3Q9QZ25 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vnn3Q9QZ25 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vnn3Q9QZ25 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vnn3Q9QZ25 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vnn3Q9QZ25 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vnn3Q9QZ25 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vnn3Q9QZ25 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vnn3Q9QZ25 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vnn3Q9QZ25 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vnn3Q9QZ25 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vnn3Q9QZ25 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vnn3Q9QZ25 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vnn3Q9QZ25 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vnn3Q9QZ25 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vnn3Q9QZ25 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vnn3Q9QZ25 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vnn3Q9QZ25 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vnn3Q9QZ25 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vnn3Q9QZ25 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vnn3Q9QZ25 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vnn3Q9QZ25 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Vnn3Q9QZ25 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vnn3Q9QZ25 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vnn3Q9QZ25 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vnn3Q9QZ25 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vnn3Q9QZ25 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vnn3Q9QZ25 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vnn3Q9QZ25 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vnn3Q9QZ25 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vnn3Q9QZ25 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vnn3Q9QZ25 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vnn3Q9QZ25 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vnn3Q9QZ25 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vnn3Q9QZ25 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vnn3Q9QZ25 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vnn3Q9QZ25 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vnn3Q9QZ25 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vnn3Q9QZ25 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vnn3Q9QZ25 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vnn3Q9QZ25 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vnn3Q9QZ25 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vnn3Q9QZ25 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vnn3Q9QZ25 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vnn3Q9QZ25 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vnn3Q9QZ25 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vnn3Q9QZ25 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vnn3Q9QZ25 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vnn3Q9QZ25 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vnn3Q9QZ25 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vnn3Q9QZ25 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vnn3Q9QZ25 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vnn3Q9QZ25 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Vnn3Q9QZ25 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vnn3Q9QZ25 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vnn3Q9QZ25 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vnn3Q9QZ25 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vnn3Q9QZ25 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms