Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM9

Psma6, Proteasome subunit alpha type-6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma6Q9QUM9 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Psma6Q9QUM9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psma6Q9QUM9 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms