Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM83

Calm4, Calmodulin-4, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calm4Q9JM83 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calm4Q9JM83 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calm4Q9JM83 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calm4Q9JM83 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calm4Q9JM83 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calm4Q9JM83 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calm4Q9JM83 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Calm4Q9JM83 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calm4Q9JM83 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calm4Q9JM83 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calm4Q9JM83 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calm4Q9JM83 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calm4Q9JM83 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calm4Q9JM83 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calm4Q9JM83 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calm4Q9JM83 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calm4Q9JM83 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calm4Q9JM83 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calm4Q9JM83 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calm4Q9JM83 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Calm4Q9JM83 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calm4Q9JM83 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calm4Q9JM83 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calm4Q9JM83 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calm4Q9JM83 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calm4Q9JM83 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calm4Q9JM83 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calm4Q9JM83 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calm4Q9JM83 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calm4Q9JM83 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calm4Q9JM83 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Calm4Q9JM83 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Calm4Q9JM83 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calm4Q9JM83 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calm4Q9JM83 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calm4Q9JM83 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calm4Q9JM83 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Calm4Q9JM83 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Calm4Q9JM83 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms