Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK1

Stx6, Syntaxin-6, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx6Q9JKK1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Stx6Q9JKK1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Stx6Q9JKK1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Stx6Q9JKK1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Stx6Q9JKK1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Stx6Q9JKK1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Stx6Q9JKK1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Stx6Q9JKK1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Stx6Q9JKK1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Stx6Q9JKK1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Stx6Q9JKK1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Stx6Q9JKK1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Stx6Q9JKK1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Stx6Q9JKK1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Stx6Q9JKK1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Stx6Q9JKK1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Stx6Q9JKK1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Stx6Q9JKK1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Stx6Q9JKK1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Stx6Q9JKK1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Stx6Q9JKK1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Stx6Q9JKK1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Stx6Q9JKK1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Stx6Q9JKK1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Stx6Q9JKK1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Stx6Q9JKK1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Stx6Q9JKK1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Stx6Q9JKK1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Stx6Q9JKK1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Stx6Q9JKK1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Stx6Q9JKK1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Stx6Q9JKK1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Stx6Q9JKK1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Stx6Q9JKK1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Stx6Q9JKK1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Stx6Q9JKK1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Stx6Q9JKK1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Stx6Q9JKK1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Stx6Q9JKK1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Stx6Q9JKK1 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Stx6Q9JKK1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Stx6Q9JKK1 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Stx6Q9JKK1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Stx6Q9JKK1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Stx6Q9JKK1 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Stx6Q9JKK1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Stx6Q9JKK1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Stx6Q9JKK1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Stx6Q9JKK1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Stx6Q9JKK1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Stx6Q9JKK1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Stx6Q9JKK1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Stx6Q9JKK1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Stx6Q9JKK1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Stx6Q9JKK1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Stx6Q9JKK1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Stx6Q9JKK1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Stx6Q9JKK1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Stx6Q9JKK1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Stx6Q9JKK1 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Stx6Q9JKK1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Stx6Q9JKK1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Stx6Q9JKK1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Stx6Q9JKK1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Stx6Q9JKK1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Stx6Q9JKK1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Stx6Q9JKK1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Stx6Q9JKK1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Stx6Q9JKK1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Stx6Q9JKK1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Stx6Q9JKK1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Stx6Q9JKK1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Stx6Q9JKK1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Stx6Q9JKK1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Stx6Q9JKK1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Stx6Q9JKK1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Stx6Q9JKK1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Stx6Q9JKK1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Stx6Q9JKK1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Stx6Q9JKK1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Stx6Q9JKK1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Stx6Q9JKK1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Stx6Q9JKK1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Stx6Q9JKK1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Stx6Q9JKK1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Stx6Q9JKK1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Stx6Q9JKK1 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Stx6Q9JKK1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Stx6Q9JKK1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Stx6Q9JKK1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Stx6Q9JKK1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Stx6Q9JKK1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Stx6Q9JKK1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Stx6Q9JKK1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Stx6Q9JKK1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Stx6Q9JKK1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Stx6Q9JKK1 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Stx6Q9JKK1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Stx6Q9JKK1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Stx6Q9JKK1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms