Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS8

Slc12a4, Solute carrier family 12 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,085 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a4Q9JIS8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc12a4Q9JIS8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc12a4Q9JIS8 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc12a4Q9JIS8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc12a4Q9JIS8 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc12a4Q9JIS8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc12a4Q9JIS8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc12a4Q9JIS8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc12a4Q9JIS8 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc12a4Q9JIS8 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc12a4Q9JIS8 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc12a4Q9JIS8 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc12a4Q9JIS8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc12a4Q9JIS8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc12a4Q9JIS8 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc12a4Q9JIS8 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc12a4Q9JIS8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slc12a4Q9JIS8 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc12a4Q9JIS8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc12a4Q9JIS8 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc12a4Q9JIS8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc12a4Q9JIS8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc12a4Q9JIS8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc12a4Q9JIS8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc12a4Q9JIS8 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc12a4Q9JIS8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc12a4Q9JIS8 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc12a4Q9JIS8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc12a4Q9JIS8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc12a4Q9JIS8 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slc12a4Q9JIS8 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc12a4Q9JIS8 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc12a4Q9JIS8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc12a4Q9JIS8 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc12a4Q9JIS8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc12a4Q9JIS8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc12a4Q9JIS8 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc12a4Q9JIS8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc12a4Q9JIS8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc12a4Q9JIS8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc12a4Q9JIS8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc12a4Q9JIS8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc12a4Q9JIS8 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc12a4Q9JIS8 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc12a4Q9JIS8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc12a4Q9JIS8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc12a4Q9JIS8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc12a4Q9JIS8 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc12a4Q9JIS8 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slc12a4Q9JIS8 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc12a4Q9JIS8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc12a4Q9JIS8 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc12a4Q9JIS8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc12a4Q9JIS8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc12a4Q9JIS8 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc12a4Q9JIS8 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc12a4Q9JIS8 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc12a4Q9JIS8 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc12a4Q9JIS8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc12a4Q9JIS8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc12a4Q9JIS8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc12a4Q9JIS8 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc12a4Q9JIS8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc12a4Q9JIS8 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc12a4Q9JIS8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc12a4Q9JIS8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc12a4Q9JIS8 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Slc12a4Q9JIS8 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc12a4Q9JIS8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc12a4Q9JIS8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc12a4Q9JIS8 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc12a4Q9JIS8 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc12a4Q9JIS8 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc12a4Q9JIS8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc12a4Q9JIS8 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc12a4Q9JIS8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc12a4Q9JIS8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc12a4Q9JIS8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc12a4Q9JIS8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc12a4Q9JIS8 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc12a4Q9JIS8 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc12a4Q9JIS8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc12a4Q9JIS8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc12a4Q9JIS8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc12a4Q9JIS8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc12a4Q9JIS8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Slc12a4Q9JIS8 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc12a4Q9JIS8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc12a4Q9JIS8 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc12a4Q9JIS8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc12a4Q9JIS8 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc12a4Q9JIS8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc12a4Q9JIS8 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc12a4Q9JIS8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc12a4Q9JIS8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc12a4Q9JIS8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Slc12a4Q9JIS8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc12a4Q9JIS8 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc12a4Q9JIS8 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Slc12a4Q9JIS8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms