Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESG4

Tmem27, Collectrin, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem27Q9ESG4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tmem27Q9ESG4 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem27Q9ESG4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tmem27Q9ESG4 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem27Q9ESG4 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem27Q9ESG4 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem27Q9ESG4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem27Q9ESG4 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem27Q9ESG4 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem27Q9ESG4 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem27Q9ESG4 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem27Q9ESG4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem27Q9ESG4 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem27Q9ESG4 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem27Q9ESG4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem27Q9ESG4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem27Q9ESG4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem27Q9ESG4 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem27Q9ESG4 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem27Q9ESG4 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem27Q9ESG4 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem27Q9ESG4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem27Q9ESG4 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tmem27Q9ESG4 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem27Q9ESG4 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem27Q9ESG4 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem27Q9ESG4 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem27Q9ESG4 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem27Q9ESG4 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem27Q9ESG4 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem27Q9ESG4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem27Q9ESG4 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem27Q9ESG4 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem27Q9ESG4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem27Q9ESG4 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem27Q9ESG4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem27Q9ESG4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tmem27Q9ESG4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem27Q9ESG4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem27Q9ESG4 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem27Q9ESG4 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem27Q9ESG4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem27Q9ESG4 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem27Q9ESG4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem27Q9ESG4 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem27Q9ESG4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem27Q9ESG4 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem27Q9ESG4 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tmem27Q9ESG4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem27Q9ESG4 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem27Q9ESG4 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem27Q9ESG4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem27Q9ESG4 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem27Q9ESG4 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem27Q9ESG4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem27Q9ESG4 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem27Q9ESG4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem27Q9ESG4 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem27Q9ESG4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem27Q9ESG4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem27Q9ESG4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem27Q9ESG4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem27Q9ESG4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem27Q9ESG4 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem27Q9ESG4 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem27Q9ESG4 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem27Q9ESG4 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem27Q9ESG4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem27Q9ESG4 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem27Q9ESG4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tmem27Q9ESG4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem27Q9ESG4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem27Q9ESG4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem27Q9ESG4 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem27Q9ESG4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem27Q9ESG4 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem27Q9ESG4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem27Q9ESG4 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem27Q9ESG4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmem27Q9ESG4 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms