Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK0

Ripk4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 786 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk4Q9ERK0 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ripk4Q9ERK0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ripk4Q9ERK0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ripk4Q9ERK0 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ripk4Q9ERK0 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ripk4Q9ERK0 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ripk4Q9ERK0 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ripk4Q9ERK0 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ripk4Q9ERK0 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ripk4Q9ERK0 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ripk4Q9ERK0 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ripk4Q9ERK0 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ripk4Q9ERK0 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ripk4Q9ERK0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ripk4Q9ERK0 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ripk4Q9ERK0 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ripk4Q9ERK0 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ripk4Q9ERK0 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ripk4Q9ERK0 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ripk4Q9ERK0 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ripk4Q9ERK0 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ripk4Q9ERK0 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ripk4Q9ERK0 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ripk4Q9ERK0 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ripk4Q9ERK0 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ripk4Q9ERK0 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ripk4Q9ERK0 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ripk4Q9ERK0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ripk4Q9ERK0 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ripk4Q9ERK0 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ripk4Q9ERK0 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ripk4Q9ERK0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ripk4Q9ERK0 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ripk4Q9ERK0 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ripk4Q9ERK0 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ripk4Q9ERK0 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ripk4Q9ERK0 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ripk4Q9ERK0 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ripk4Q9ERK0 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ripk4Q9ERK0 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ripk4Q9ERK0 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ripk4Q9ERK0 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ripk4Q9ERK0 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ripk4Q9ERK0 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ripk4Q9ERK0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ripk4Q9ERK0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ripk4Q9ERK0 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ripk4Q9ERK0 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ripk4Q9ERK0 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ripk4Q9ERK0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ripk4Q9ERK0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ripk4Q9ERK0 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ripk4Q9ERK0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ripk4Q9ERK0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ripk4Q9ERK0 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ripk4Q9ERK0 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ripk4Q9ERK0 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ripk4Q9ERK0 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ripk4Q9ERK0 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ripk4Q9ERK0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ripk4Q9ERK0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ripk4Q9ERK0 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ripk4Q9ERK0 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ripk4Q9ERK0 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ripk4Q9ERK0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ripk4Q9ERK0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ripk4Q9ERK0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ripk4Q9ERK0 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ripk4Q9ERK0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ripk4Q9ERK0 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ripk4Q9ERK0 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ripk4Q9ERK0 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ripk4Q9ERK0 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ripk4Q9ERK0 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ripk4Q9ERK0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ripk4Q9ERK0 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ripk4Q9ERK0 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ripk4Q9ERK0 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ripk4Q9ERK0 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ripk4Q9ERK0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ripk4Q9ERK0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ripk4Q9ERK0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ripk4Q9ERK0 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ripk4Q9ERK0 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ripk4Q9ERK0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ripk4Q9ERK0 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ripk4Q9ERK0 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ripk4Q9ERK0 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ripk4Q9ERK0 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ripk4Q9ERK0 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ripk4Q9ERK0 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ripk4Q9ERK0 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ripk4Q9ERK0 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ripk4Q9ERK0 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ripk4Q9ERK0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ripk4Q9ERK0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ripk4Q9ERK0 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ripk4Q9ERK0 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ripk4Q9ERK0 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ripk4Q9ERK0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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