Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmem239Q9DA47 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmem239Q9DA47 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmem239Q9DA47 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmem239Q9DA47 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmem239Q9DA47 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmem239Q9DA47 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmem239Q9DA47 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmem239Q9DA47 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmem239Q9DA47 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmem239Q9DA47 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmem239Q9DA47 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmem239Q9DA47 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmem239Q9DA47 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Tmem239Q9DA47 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmem239Q9DA47 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmem239Q9DA47 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmem239Q9DA47 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmem239Q9DA47 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmem239Q9DA47 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmem239Q9DA47 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmem239Q9DA47 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmem239Q9DA47 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmem239Q9DA47 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmem239Q9DA47 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmem239Q9DA47 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmem239Q9DA47 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmem239Q9DA47 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmem239Q9DA47 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmem239Q9DA47 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmem239Q9DA47 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmem239Q9DA47 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmem239Q9DA47 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmem239Q9DA47 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Tmem239Q9DA47 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem239Q9DA47 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem239Q9DA47 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem239Q9DA47 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem239Q9DA47 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem239Q9DA47 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem239Q9DA47 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem239Q9DA47 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem239Q9DA47 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem239Q9DA47 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem239Q9DA47 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem239Q9DA47 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem239Q9DA47 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem239Q9DA47 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem239Q9DA47 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem239Q9DA47 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem239Q9DA47 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem239Q9DA47 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem239Q9DA47 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem239Q9DA47 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem239Q9DA47 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem239Q9DA47 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem239Q9DA47 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem239Q9DA47 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem239Q9DA47 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem239Q9DA47 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Tmem239Q9DA47 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem239Q9DA47 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem239Q9DA47 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem239Q9DA47 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem239Q9DA47 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem239Q9DA47 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem239Q9DA47 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem239Q9DA47 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem239Q9DA47 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem239Q9DA47 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem239Q9DA47 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem239Q9DA47 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem239Q9DA47 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem239Q9DA47 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem239Q9DA47 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem239Q9DA47 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem239Q9DA47 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Tmem239Q9DA47 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Tmem239Q9DA47 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Tmem239Q9DA47 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Tmem239Q9DA47 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC14.33□□□□□ -0.11
Tmem239Q9DA47 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Tmem239Q9DA47 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Tmem239Q9DA47 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmem239Q9DA47 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmem239Q9DA47 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmem239Q9DA47 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmem239Q9DA47 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmem239Q9DA47 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmem239Q9DA47 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmem239Q9DA47 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmem239Q9DA47 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmem239Q9DA47 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmem239Q9DA47 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmem239Q9DA47 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmem239Q9DA47 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmem239Q9DA47 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmem239Q9DA47 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmem239Q9DA47 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Tmem239Q9DA47 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms