Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chmp5Q9D7S9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chmp5Q9D7S9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Chmp5Q9D7S9 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chmp5Q9D7S9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chmp5Q9D7S9 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chmp5Q9D7S9 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chmp5Q9D7S9 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chmp5Q9D7S9 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chmp5Q9D7S9 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chmp5Q9D7S9 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chmp5Q9D7S9 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chmp5Q9D7S9 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chmp5Q9D7S9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chmp5Q9D7S9 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chmp5Q9D7S9 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chmp5Q9D7S9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chmp5Q9D7S9 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chmp5Q9D7S9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chmp5Q9D7S9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chmp5Q9D7S9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chmp5Q9D7S9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chmp5Q9D7S9 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chmp5Q9D7S9 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chmp5Q9D7S9 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chmp5Q9D7S9 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chmp5Q9D7S9 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chmp5Q9D7S9 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chmp5Q9D7S9 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chmp5Q9D7S9 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chmp5Q9D7S9 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chmp5Q9D7S9 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chmp5Q9D7S9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chmp5Q9D7S9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chmp5Q9D7S9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chmp5Q9D7S9 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chmp5Q9D7S9 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chmp5Q9D7S9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chmp5Q9D7S9 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chmp5Q9D7S9 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chmp5Q9D7S9 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chmp5Q9D7S9 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chmp5Q9D7S9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chmp5Q9D7S9 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chmp5Q9D7S9 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chmp5Q9D7S9 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chmp5Q9D7S9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chmp5Q9D7S9 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chmp5Q9D7S9 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chmp5Q9D7S9 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chmp5Q9D7S9 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Chmp5Q9D7S9 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Chmp5Q9D7S9 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Chmp5Q9D7S9 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Chmp5Q9D7S9 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chmp5Q9D7S9 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chmp5Q9D7S9 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chmp5Q9D7S9 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chmp5Q9D7S9 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chmp5Q9D7S9 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chmp5Q9D7S9 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Chmp5Q9D7S9 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chmp5Q9D7S9 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chmp5Q9D7S9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chmp5Q9D7S9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chmp5Q9D7S9 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chmp5Q9D7S9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chmp5Q9D7S9 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chmp5Q9D7S9 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chmp5Q9D7S9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chmp5Q9D7S9 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chmp5Q9D7S9 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chmp5Q9D7S9 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chmp5Q9D7S9 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chmp5Q9D7S9 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chmp5Q9D7S9 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chmp5Q9D7S9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chmp5Q9D7S9 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Chmp5Q9D7S9 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chmp5Q9D7S9 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Chmp5Q9D7S9 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chmp5Q9D7S9 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chmp5Q9D7S9 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chmp5Q9D7S9 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chmp5Q9D7S9 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chmp5Q9D7S9 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chmp5Q9D7S9 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chmp5Q9D7S9 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chmp5Q9D7S9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chmp5Q9D7S9 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chmp5Q9D7S9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chmp5Q9D7S9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chmp5Q9D7S9 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chmp5Q9D7S9 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chmp5Q9D7S9 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chmp5Q9D7S9 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chmp5Q9D7S9 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chmp5Q9D7S9 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chmp5Q9D7S9 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chmp5Q9D7S9 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms