Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F4

Gabra4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra4Q9D6F4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gabra4Q9D6F4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabra4Q9D6F4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabra4Q9D6F4 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabra4Q9D6F4 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabra4Q9D6F4 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabra4Q9D6F4 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gabra4Q9D6F4 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms