Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZW2

Cenpn, Centromere protein N, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpnQ9CZW2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CenpnQ9CZW2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CenpnQ9CZW2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CenpnQ9CZW2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CenpnQ9CZW2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CenpnQ9CZW2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CenpnQ9CZW2 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CenpnQ9CZW2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CenpnQ9CZW2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CenpnQ9CZW2 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CenpnQ9CZW2 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CenpnQ9CZW2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CenpnQ9CZW2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CenpnQ9CZW2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CenpnQ9CZW2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CenpnQ9CZW2 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CenpnQ9CZW2 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms