Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pfdn1Q9CWM4 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pfdn1Q9CWM4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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