Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUI2

4930535I16Rik, RIKEN cDNA 4930535I16 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930535I16RikQ9CUI2 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
4930535I16RikQ9CUI2 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms